人类短片段串联重复序列高通量测序信息的处理方法

摘要

本发明公开了人类短片段串联重复序列高通量测序信息的处理方法，属于生物检测领域。该方法为：保留单张芯片的STR高通量测序信息中具有预设测序长度的序列，形成第一序列；根据样本标签信息，将第一序列分类至不同样本文件夹中，根据STR目的片段特异引物信息，将第一序列再分类至不同STR基因座文件夹中，形成第二序列；建立针对不同STR基因座的阶梯参比序列，将第二序列与其中相应STR基因座的序列比对，保留序列相似度≥90％的第三序列；将样本测序条目数的阈值设为1000，将基因座测序条目数的阈值设为50，将基因座内分型测序条目数的阈值设为5，将基因座内分型测序条目数/基因座测序条目数的阈值设为40％，筛选第三序列中≥以上阈值的序列，得STR分型结果。