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一种基于三代测序的全基因组结构变异分析方法和系统

摘要

本发明公开了一种基于三代测序的全基因组结构变异分析方法和系统,所述方法包括1)序列拆分,2)序列比对;3)基因组结构变异初步检测;4)基因组结构变异初步检测结果合并筛选,5)基因组结构变异功能注释;所述系统包括序列拆分模块,序列比对模块,基因组结构变异初步检测模块,基因组结构变异初步检测结果合并筛选模块和基因组结构变异功能注释模块。所述方法和系统通过整合现有的三代基因组结构变异检测技术PBhoney和Sniffles,能有效提高低覆盖度下基因组结构变异检测的准确性和敏感性,在降低检测成本的同时保证检测结果的可靠性。

著录项

  • 公开/公告号CN107180166B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-09-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京希望组生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201710266327.7

  • 发明设计人 汪德鹏;方立;王凯;张朋;胡江;

    申请日2017-04-21

  • 分类号G16B20/20(20190101);

  • 代理机构42212 武汉河山金堂专利事务所(普通合伙);

  • 代理人胡清堂

  • 地址 102206 北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢A301-3室

  • 入库时间 2022-08-23 11:12:05

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