用于生物治疗蛋白质产品中的宿主细胞蛋白质污染物的检测的SWATH^TM数据独立性采集技术

摘要

本发明提供用于使用循序窗口化采集串联质谱法检测蛋白质生物治疗产品中的宿主细胞污染物的系统及方法。通过以下步骤对蛋白质生物治疗产品样本执行循序窗口化采集：使前驱体质量窗口跨质量范围循序步进，使每一步进式前驱体质量窗口的经传输前驱体离子破碎，以及分析从所述破碎的经传输前驱体离子产生的产物离子。所述循序窗口化采集是在数据采集之前无任何有关污染蛋白质的信息的情况下执行，且针对所述质量范围产生每个经传输离子的每个产物离子的数据。接收一或多个所测量产物离子谱，且将所述一或多个所测量产物离子谱与宿主细胞蛋白质库进行比较。通过报告来自所述库的匹配所述一或多个所测量产物离子谱的宿主细胞蛋白质来检测一或多个宿主细胞污染物。