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基于岭回归矫正MB‑seq甲基化水平的方法及系统

摘要

基于岭回归矫正MB‑seq甲基化水平的方法,属于基因工程技术领域,利用机器学习岭回归理论,并依据RRBS检测出来的绝对MB‑seq甲基化水平进行数据训练并建立预测模型,对基因组上的RRBS未覆盖的胞嘧啶位点进行岭回归预测,使得甲基化水平检测的准确度大于95%,从而消除MB‑seq的偏差并得到全基因组甲基化图谱。本发明还公开了一种基于岭回归的甲基化水平计算系统。利用本发明可以从高通量测序MB‑seq数据中,精确计算全基因组每一个CpG的甲基化水平。

著录项

  • 公开/公告号CN104899474B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-02-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 大连三生科技发展有限公司;

    申请/专利号CN201510313520.2

  • 发明设计人 张保荣;王晓东;张久文;

    申请日2015-06-09

  • 分类号

  • 代理机构大连智高专利事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人胡景波

  • 地址 116600 辽宁省大连市开发区东北六街六号

  • 入库时间 2022-08-23 10:07:13

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-02-09

    授权

    授权

  • 2015-10-07

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/12 申请日:20150609

    实质审查的生效

  • 2015-09-09

    公开

    公开

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