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一种处理小分子和蛋白质相互作用的计算方法

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本发明涉及一种处理小分子和蛋白质相互作用的计算方法，包括以下步骤：(1)读入蛋白质和小分子配体文件数据；(2)判断蛋白质和小分子配体中的原子类型；(3)随机初始化小分子配体的位置和角度；(4)运行SearchProtein算法，优化小分子配体的坐标和角度，Chemscore公式作为评价函数；(5)达到最大迭代次数后终止计算；(6)分析结果，RMSD、对接自由能ΔG和对接位点的坐标，输出结果。与现有技术相比，本发明具有做到对污染物与生物大分子之间时候有作用作出迅速判断等优点。

著录项

公开/公告号CN103049677B

专利类型发明专利
公开/公告日2015-11-25

原文格式PDF
申请/专利权人同济大学;
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申请/专利号CN201110315297.7
发明设计人管翀;赵国华;曹同成;黄晓峰;张莹莹;
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申请日2011-10-17
分类号G06F19/12(20110101);
代理机构31225 上海科盛知识产权代理有限公司;
代理人赵志远
地址 200092 上海市杨浦区四平路1239号
入库时间 2022-08-23 09:31:30

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2018-10-09

未缴年费专利权终止 IPC(主分类):G06F19/12 授权公告日:20151125 终止日期:20171017 申请日:20111017

专利权的终止
2015-11-25

授权

授权
2013-05-15

实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/12 申请日:20111017

实质审查的生效
2013-04-17

公开

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