邻居粒子对搜索、分子动力学计算方法及众核处理系统

摘要

本发明提供一种邻居粒子对搜索方法，适用于配置成执行分子动力学计算的众核处理系统；该方法包括：分别以各粒子作为主粒子来建立各粒子的邻居粒子对；其中，对于各主粒子，均在其所处计算区域内的其余粒子中确定该主粒子的邻粒子；从而在各计算区域内建立该计算区域内所有粒子的邻居粒子对信息。本发明还提供一种采用该邻居粒子对搜索方法的分子动力学计算方法及其众核处理系统，本发明针对邻粒子所处不同区域进行区分的邻居搜索方法，从而有利于根据邻粒子所处的区域采用不同的计算方式，充分发挥众核处理系统的从核处理能力。