一组条码接头以及中通量多重单细胞代表性DNA甲基化建库和测序方法

摘要

本发明提供了一组含样品条码的粘性接头，用于特异标记不同样品；每个接头由短寡核苷酸和长寡核苷酸形成，不同接头设置独特的条码序列；该接头直接连接限制性酶切的基因组DNA片段末端，用于标记多个单细胞或群体细胞或纯化的DNA样品并可进行其扩增。本发明还提供了同时检测多个样品CpG甲基化的方法，简称M‑scRRBS，及其替代性方法M‑scRRAS，采用上述接头特异标记多个样品，包括每个样品的所有DNA片段，再把多个样品合并，实现多样品的单管反应，进行后续的转化、测序文库构建和测序、各样品读数分流解码及下游分析。本发明的建库技术与scWGBS和scRRBS方法相比，具有高效率、低成本、操作稳定方便等优势。