模型训练、药物筛选和亲和力预测的方法与装置

摘要

本申请实施例提供一种模型训练、药物筛选和亲和力预测的方法与装置。本申请实施例提供一种预测小分子化合物与蛋白质之间亲和力的方法，其包括：基于复合物的三维构象确定接入区域，所述复合物由待分析的所述小分子化合物和所述蛋白质形成；基于所述接入区域内的原子以及化学键的特征，构建拓扑图G；基于所述拓扑图G，确定特征向量；利用经过训练的机器学习模型对所述特征向量进行处理，以获得所述化合物与所述蛋白质之间的亲和力。利用该方法可以提高小分子化合物与蛋白质之间亲和力预测的效率、可解释性、可重复性、准确度和精度。