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一种基于全长小亚基核糖体RNA的反转录来分析微生物群落结构的方法

摘要

本发明涉及一种基于全长小亚基核糖体RNA的反转录来分析微生物群落结构的方法,包括以下步骤:(1)快速提取样品中的总RNA;(2)在RNA的5’端加第一接头序列;(3)在能够覆盖真核和原核生物的通用反向引物的5’端加第二接头序列,用于反转录小亚基核糖体RNA;(4)在反转录产物中筛选核糖体SSU cDNA;(5)进行PCR扩增,获得双链全长核糖体SSU cDNA,对扩增产物进行测序,并提取出全长SSU rRNA序列;(6)根据所得全长SSU rRNA序列确定准确的分类信息,获得精细的微生物群落结构。与现有技术相比,本发明不使用“通用”正向引物,减少PCR过程产生的偏差,能够得到常规“通用”引物PCR扩增遗漏的微生物,并同时分析细菌、古生菌和真核微生物的整体群落结构等。

著录项

  • 公开/公告号CN111996245A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-11-27

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 复旦大学;

    申请/专利号CN202010881408.X

  • 发明设计人 全哲学;张汝毅;阎永伟;

    申请日2020-08-27

  • 分类号C12Q1/6869(20180101);C12Q1/04(20060101);

  • 代理机构31225 上海科盛知识产权代理有限公司;

  • 代理人刘燕武

  • 地址 200433 上海市杨浦区邯郸路220号

  • 入库时间 2023-06-19 09:03:00

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-12-16

    授权

    发明专利权授予

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