一种基于perl语言快速批量去除载体序列的方法

摘要

本发明公开了一种基于perl语言快速批量去除载体序列的方法，包括如下步骤：步骤一：使用测序结果文本格式的文件或将测序峰图文件使用Chromas软件进行格式转换；步骤二：通过定位匹配载体插入位点两端序列，对所述载体序列进行特异性去除；通过脚本里设置好的载体插入位点两端序列和测序结果里的序列进行比对匹配；步骤三：过滤不合格的测序结果；通过脚本里设置好的载体插入位点两端序列和测序结果里的序列进行比对匹配，无完全匹配或匹配小于7个以上碱基，默认不合格序列，不输出；步骤四：输出无载体序列结果，根据所述载体插入位点两端序列的方向性调整输出结果。本发明的方法可以一次性去除多个序列，不限制单次处理数据量的个数。