用于全基因组序列数据的从头组装的系统、方法和介质

摘要

描述了用于从个体的核酸样品生成的核酸序列数据的从头定相二倍体组装的计算机实现的方法、系统和介质，所述核酸序列数据利用核酸标签来保留所述个体的长程序列上下文，以使得从共同起始序列导出的短读取序列数据的子集共享共同标签。所述定相的二倍体组装在不与源自除所述个体以外的生物体的参考序列比对的情况下实现。所描述的方法、系统和介质是计算机资源有效的，从而允许按比例放大。