首页> 中国专利> 一种PacBio测序数据组装得到的基因组序列的纠错方法

一种PacBio测序数据组装得到的基因组序列的纠错方法

摘要

本发明提供一种PacBio测序数据组装后序列的纠错方法,它包括以下步骤:步骤一:使用比对软件将Illumina测序数据比对到PacBio测序数据组装得到的基因组序列上;步骤二:提取可能存在错误的位置和对应位置的碱基类型信息;步骤三:提取可能存在错误的位置的碱基类型的覆盖深度信息;步骤四:根据可能存在错误的位置的不同碱基类型覆盖深度比较,进行基因组序列替换纠,得到新的基因组序列。本发明移除了PacBio测序数据组装序列后单碱基错误和碱基插入缺失错误,有效的提高了组装序列的准确度。

著录项

  • 公开/公告号CN107563151A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-01-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杭州和壹基因科技有限公司;

    申请/专利号CN201710838912.X

  • 发明设计人 郝美荣;詹东亮;

    申请日2017-09-18

  • 分类号G06F19/18(20110101);G06F19/22(20110101);

  • 代理机构33212 杭州中成专利事务所有限公司;

  • 代理人唐银益

  • 地址 310051 浙江省杭州市滨江区长河街道聚才路88号远方科技中心15楼

  • 入库时间 2023-06-19 04:17:49

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-02-02

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20170918

    实质审查的生效

  • 2018-01-09

    公开

    公开

相似文献

  • 专利
  • 中文文献
  • 外文文献
获取专利

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号