使用脉冲读数光学的通过合成测序

摘要

本文提供了使用具有光敏封闭基团的可检测地标记的链终止核苷酸和光断裂光的脉冲，在多个孔中用于核酸通过合成测序的系统和方法。在某些实施方案中，该系统和方法提供多个包含初始去封闭时段，接着光扫描时段的去封闭‑扫描循环，其中在每个去封闭‑扫描循环中至少一个以下事件发生：1) 去封闭时段短于扫描时段；2) 去封闭时段仅仅足够长至在不到所有的多个孔中使作为引物的一部分的光敏基团去封闭；或3) 去封闭时段是在25和150 mSec之间和扫描时间是至少200 mSec。这样较短的去封闭时段有助于防止在扫描之前添加一个以上的核苷酸至引物(例如，提高准确度)。