雷蒙德氏棉功能着丝粒序列及其分子标记

摘要

本发明提供了雷蒙德氏棉功能着丝粒序列及其相应的分子标记。我们利用染色质免疫共沉淀与高通量测序技术相结合（ChIP-Seq）的方法得到了雷蒙德氏棉功能着丝粒区域的四条DNA序列。根据该序列分别设计引物，用于雷蒙德氏棉有丝分裂中期荧光原位杂交（FISH）。结果显示，这四条序列均在全部染色体的着丝粒区域产生集中且清晰明亮的信号。本发明的着丝粒序列可直接用于功能着丝粒的定位及相关序列的鉴定；所开发的标记可用于棉花遗传图谱着丝粒位置的遗传定位，为功能基因定位及连锁关系提供更加准确的信息，也能为雷蒙德氏棉全基因组测序的序列拼接提供借鉴和帮助，使得其物理图谱信息更加全面。