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靶向抑制PPP2R5C基因表达和肿瘤T细胞增殖的PPP2R5C-siRNA991及其应用

摘要

本发明公开了一种靶向抑制PPP2R5C基因表达和肿瘤T细胞增殖的PPP2R5C-siRNA991及其应用。PPP2R5C-siRNA991的正义链为5’-CAGUGGUGAUGGCACUUCUCAAAUA -3’;反义链为5’-UAUUUGAGAAGUGCCAUCACCACUG-3’。PPP2R5C-siRNA991能高效抑制PPP2R5C基因的表达,mRNA的下调程度达到2~4倍,蛋白表达明显得到抑制;同时其能有效抑制肿瘤性T细胞的增殖。本发明所提供的siRNA对于开发新的抗T细胞肿瘤基因药物和提高T细胞肿瘤的治疗效果有重要的意义,具有很大的应用前景和经济价值。

著录项

  • 公开/公告号CN102382828A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2012-03-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 暨南大学;

    申请/专利号CN201110337837.1

  • 申请日2011-10-31

  • 分类号C12N15/113;A61K48/00;A61P35/00;A61P35/02;

  • 代理机构广州市华学知识产权代理有限公司;

  • 代理人裘晖

  • 地址 510632 广东省广州市黄埔大道西601号

  • 入库时间 2023-12-18 04:51:31

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2013-03-13

    授权

    授权

  • 2012-06-06

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N15/113 申请日:20111031

    实质审查的生效

  • 2012-03-21

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及一种siRNA,特别涉及一种靶向抑制PPP2R5C基因表达和肿瘤 T细胞增殖的PPP2R5C-siRNA991及其应用。

背景技术

血液肿瘤是发病率较高的恶性肿瘤之一,每年全国约有10万初发病人,严 重危害人们、尤其是青少年的健康。T细胞肿瘤是血液肿瘤的一种主要类型, 主要由于T细胞恶性克隆增殖而形成,包括多种类型的T细胞白血病和淋巴瘤, 多数恶性程度高,治疗效果差,预后不良。临床治疗上一直存在难治疗、耐药 和易复发等难题,因此寻找更有效和特异的治疗方案一直是研究者的一个重要 目标。随着对肿瘤细胞分子特点的逐渐明确,不断发现肿瘤T细胞特异的分子, 设计和研制有效的靶向治疗药物,成为提高T细胞肿瘤治疗效果的一个重要手 段。

PPP2R5C基因是在1996年被发现并克隆出来的。是蛋白磷酸酶2A(PP2A) 的一个亚单位,在调节细胞增殖、分化和转化等过程中具有重要作用,目前研 究认为其属于一种抑癌基因。近期研究提示其表达模式的改变与细胞恶性转化 相关,我们的前期研究也发现PPP2R5C在T细胞肿瘤中有异常高表达情况。

近年来,利用RNA干扰技术,将化学合成的小干扰RNA(small interfering  RNA,siRNA)转导至特定的细胞,沉默相关基因的表达,是研究基因功能最 有效的手段之一,也是靶向基因治疗最有吸引力的方法之一。选择特异性的靶 基因合成有效的siRNA,并且选择合适转染方式,使其在宿主细胞中高效作用, 是实施这一靶向治疗措施的重点。靶向针对PPP2R5C基因的siRNA序列对于 开发新的抗T细胞肿瘤基因药物和提高T细胞肿瘤的治疗效果有重要的意义, 具有很大的应用前景和经济价值。

发明内容

本发明的首要目的在于提供一种靶向抑制PPP2R5C基因表达和肿瘤T细胞 增殖的siRNA,名称为PPP2R5C-siRNA991。

本发明的另一目的在于提供上述PPP2R5C-siRNA991的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现:一种靶向抑制PPP2R5C基因表达和 肿瘤T细胞增殖的PPP2R5C-siRNA991,核糖核苷酸序列如下所示:

正义链5’-CAGUG GUGAU GGCAC UUCUC AAAUA-3’

反义链5’-UAUUU GAGAA GUGCC AUCAC CACUG-3’。

所述的靶向抑制PPP2R5C基因表达和肿瘤T细胞增殖的 PPP2R5C-siRNA991用于制备抑制PPP2R5C基因表达的制剂。

所述靶向抑制PPP2R5C基因表达的siRNA应用于制备治疗T细胞肿瘤的 药物。

所述T细胞肿瘤为T细胞白血病。

本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:

1、本发明所提供的PPP2R5C-siRNA991能高效抑制PPP2R5C基因的表达, mRNA的下调程度达到2~4倍,蛋白表达明显得到抑制,如图2和图3所示。

2、本发明所提供的PPP2R5C-siRNA991能有效抑制肿瘤性T细胞的增殖, 如图4所示。

3、本发明所提供的PPP2R5C-siRNA991对于开发新的抗T细胞肿瘤基因药 物和提高T细胞肿瘤的治疗效果有重要的意义,其具有很大的应用前景和经济 价值。

附图说明

图1是实施例1中通过流式细胞仪检测Molt-4细胞转染效率图,其中:

A为转染Alexa Red Oligo的柱形图;

B为对照组的柱形图。

图2是实施例2的实验组和对照组的实时定量PCR结果图。

图3是实施例2的实验组和对照组的PPP2R5C蛋白水平变化Western Blot 图(RNA干扰后48h)。

图4是通过Annexin V/PI双染后流式细胞仪得到的实验组和对照组的细胞 凋亡图。

具体实施方式

下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方 式不限于此。

实施例1

siRNA的合成和转染T淋巴细胞白血病细胞株(Molt-4)(购自中科院上海 细胞所)细胞条件的稳定,具体步骤如下:

(1)设计和得到siRNA

在GenBank(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)里查找PPP2R5C基因 序列(ACCESSION NM_178587),然后根据Invitrogen公司(www. invitrogen.com)提供的StealthTMRNAi设计法则,在线设计针对PPP2R5C的 siRNA。本发明所涉及的靶向抑制PPP2R5C基因表达的siRNA是从PPP2R5C 基因序列991bp开始的25nt siRNA(称为siRNA-991),同时设计与目的基因序 列无同源性的无关序列siRNA(non-silencing scrambled control,SC,25nt)为 对照组,siRNA均由美国Invitrogen公司化学合成。

siRNA-991的序列如下:

正义链序列:5’-CAGUGGUGAUGGCACUUCUCAAAUA-3’;

反义链序列:5’-UAUUUGAGAAGUGCCAUCACCACUG-3’。

无关序列siRNA的序列如下:

正义链序列:5’-UAGUCUACCUAGCUUAACCCAGUAA-3’;

反义链序列:5’-UUACUGGGUUAAGCUAGGUAGACUA-3’。

(2)准备处于对数生长期的Molt-4细胞

将Molt-4细胞接种于含体积分数10%新生牛血清、100U/mL青霉素和 100U/mL链霉素的RPMI1640培养基中,在含体积百分数5%CO2的培养箱37℃ 连续培养,2~3天传代一次,得到处于对数生长期的Molt-4细胞。

(3)PPP2R5C-siRNA991转染Molt-4细胞

A、收集2.5×106个Molt-4细胞,200g离心10min,完全去除上清;

B、用100μl预热至室温的NucleofectorTM Solution和Supplement混合液 (Amaxa,德国)悬浮细胞;

C、加入100nM Alexa Red Oligo(Invitrogen,美国),混匀后加入核转杯 (Amaxa,德国),启动Molt-4特异性程序C-005;同时设置对照组,对照组为与 转染Alexa Red Oligo的步骤相同,但是没有加入Alexa Red Oligo;

D、程序完成后立刻用核转染试剂盒(Amaxa,德国)里配套的移液器将转 染后的细胞液接种于培养瓶中,终体积为5ml;

E、放入培养箱10小时后利用荧光显微镜和流式细胞仪检测荧光值,分析转 染效率。

通过荧光显微镜和流式细胞仪检测的结果如图1所示,可见通过上述转染 方法的转染效率稳定在56.2±14.14%。

实施例2

将siRNA-991转染Molt-4细胞后,检测PPP2R5C基因在mRNA和蛋白水 平的表达,明确其干扰效应。

(1)实验分组:实验组为转染siRNA-991,对照组分别为无关序列对照组 (SC)、转染条件对照组(MOCK)和空白对照组(NC),实验方法同实施例 1步骤(3),各组的siRNA量均为3μg。转染条件对照组系不加入siRNA,其 余处理条件同实验组,空白对照组是未经任何实验处理的细胞。

(2)荧光实时定量PCR检测:分别收集各组转染后24h、48h和72h的细胞, 按照TRIZol试剂盒(invitrogen,USA)说明书操作步骤提取RNA,并使用AMMLV (promega,USA)和OLIGO dT合成cDNA(根据AMMLV的说明书操作)。应用 于荧光实时定量PCR的引物序列见表1,以β2M基因作为内参照。总反应体积为 20μl,包括Real Master Mix 9μL,上、下游引物的终浓度分别为0.5μmol/L以及1μl cDNA。在95℃、3min变性后,共进行40循环扩增,每一循环包括95℃、10s和 62℃、30s。采用相对定量法(2ΔCt×100%,ΔCt=Ct目的基因-Ct内参基因)计算 PPP2R5C mRNA的相对表达量。结果显示,转染后24h、48h和72h,与各对照组 相比,siRNA-991组PPP2R5C的mRNA表达水平均明显下调,下调倍数约为2~4 倍不等(如表2和图2所示)。

表1应用于实时定量PCR的引物序列

表2:实时定量PCR检测转染后PPP2R5C基因mRNA水平变化

*:P<0.05  siRNA-991 VS 其余各组

(3)蛋白水平检测:分别收集转染后48h和72h的细胞,应用蛋白裂解液 试剂盒,提取总蛋白,Western blot ECL发光法显影成像、分析转染后各组 PPP2R5C蛋白水平的表达情况。具体方法如下:

A、收集各组不同时间段的细胞,数目为1×106个,用RIPA蛋白提取试剂 盒(碧云天,上海)提取总蛋白;

B、SDS-PAGE电泳:将各组样品按常规方法定量并变性后加样于10%的 SDS-PAGE胶中(每孔加样量约为30μg),恒压80V,30min后改为100V, 60min;

C、转膜:将切好的PVDF膜(PALL,美国)和脱脂棉预先泡在转膜液中 15~30min,用半干转仪(Bio-Rad,美国)按照安全盖+电转盖+脱脂棉+ SDS-PAGE胶+PVDF膜+脱脂棉+电机板的顺序从上向下排列,恒压10V, 25min;

D、封膜:用浓度为30g/L脱脂奶粉作为Blocking Reagent(封闭试剂)封膜 2h后用0.05%PBST洗涤液{500μl吐温-20(SIGMA,USA)+1L PBS,PBS的浓度 为0.01mol/L、pH值为7.4}洗涤3次,每次5min。

E、一抗、二抗的孵育:将PVDF膜按所需要的蛋白分子量大小(β-actin为 42kD,PPP2R5C蛋白为61kD)和预染Marker的位置剪成两条,分别放入体积 比1∶500的小鼠抗人β-actin一抗(武汉博士德公司)和1∶200的兔抗人PPP2R5C 一抗(Santa,美国)4℃过夜,或37℃1h后用0.05%PBST洗涤液洗涤3次, 每次5min。再分别放入1∶500的羊抗小鼠和羊抗兔二抗(eBioscience,美国) 37℃孵育1h,用0.05%PBST洗涤液洗涤3次,每次5min;

F、ECL显色:通过ECL显色试剂盒显色(碧云天,上海),经化学发光后 观察内参β-actin和目的蛋白PPP2R5C的表达量,最后利用UVI Alliance 4.7凝 胶成像仪(UVI,UK)进行拍照,根据实验结果调整曝光时间。

Western blot结果(见图3)显示,与各对照组相比,转染后48h后siRNA-991 组PPP2R5C蛋白水平表达均明显下调,,与SC组相比,蛋白表达明显得到抑制 即本发明提供的靶向抑制PPP2R5C基因表达的siRNA能有效下调Molt-4细胞 中PPP2R5C基因的表达

实施例3

此实施例表明了siRNA-991下调Molt-4细胞PPP2R5C表达后所产生的生 物学效应。包括形态学变化、细胞增殖和凋亡和细胞周期的变化等。

(1)形态学变化:各组取约1×104细胞,按Hoechst 33258试剂盒(碧云 天,上海)操作步骤进行核染色,染色后用荧光显微镜观察细胞形态。结果显 示siRNA-991组细胞呈明显的细胞凋亡形态学改变:细胞核呈致密浓染,或呈 碎块状致密浓染,而其余各对照组细胞核呈正常的蓝色。

(2)CCK-8法检测细胞增殖情况:转染结束立即取各组细胞约1×104个, 每组平行取3孔,放入培养箱中72h后加入10μl的CCK-8溶液(同仁化学研究 所,日本),37℃孵育2h后于450nm(SYNERGY4全自动酶标仪,Bio-TEK, USA)处检测各组OD值,计算抑制率。结果显示,与各对照组相比,siRNA-991 组可以明显抑制细胞的增殖(如表3所示)。

表3:CCK-8法检测转染72h后对Molt-4细胞增殖的影响

*:P<0.05 siRNA-991 VS其余各组

(3)流式细胞仪检测细胞凋亡情况:转染72h后取各组细胞约1×105个, 用预冷(4℃)的PBS(浓度0.01M,pH 7.4)洗涤细胞2次,1ml Annexin V-FITC 结合缓冲液洗细胞2次,离心(1000rpm,5min)去上清,加入200μl Annexin V-FITC结合缓冲液,重悬细胞后,分别加入10μl Annexin V和5μl PI溶液,轻 轻混匀,避光反应30min,立即上机检测,Winmdi软件分析结果。结果显示, 与各对照组相比,siRNA-991组细胞早期和中晚期凋亡均有所增加(图4)。

上述实验结果说明了本发明提供的靶向抑制PPP2R5C基因表达的siRNA 具有明显的抑制T淋巴肿瘤细胞增殖、同时也有一定的诱导T淋巴肿瘤细胞凋 亡的功能。

上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施 例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替 代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。

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