甲醛交联/染色质免疫沉淀与分子克隆相结合筛选HSF靶DNA的方法

摘要

本发明公开了一种甲醛交联/染色质免疫沉淀与分子克隆相结合筛选HSF靶DNA的方法，本发明的方法采用染色质免疫沉淀(ChIP)与分子克隆技术相结合的方法在体内分离和鉴定了拟南芥热激转录因子HSF结合的靶DNA。首先热激诱导拟南芥叶片的HSF与靶DNA结合，接着甲醛处理使HSF与靶DNA共价交联，然后用HSF抗体进行染色质免疫沉淀，染色质免疫沉淀DNA经过衔接头介导的PCR扩增并进行分子克隆，最后进行测序，并将测序结果在基因组数据库中分析、鉴定靶DNA片段在基因组上的位置及对应的HSF靶基因。甲醛交联/染色质免疫沉淀技术与分子克隆相结合是筛选热激转录因子(HSF)的靶DNA的理想方法。