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蛋白质序列数据库并行搜索鉴定方法与装置

摘要

本申请涉及一种蛋白质序列数据库并行搜索鉴定方法、装置、计算机设备和存储介质,其中,方法包括:预处理待鉴定的实验质谱数据集和蛋白质序列数据库,对蛋白序列数据库中每条蛋白序列进行模拟酶切,获取理论质谱数据集;分别提取实验质谱数据集对应的每个实验质谱图的质谱峰,生成搜索查询集合,并根据搜索查询集合在蛋白质序列库中搜索理论质谱数据集,获取候选肽段序列集合;根据每个实验质谱图及其对应的候选肽段序列集合,生成候选肽段并打分;整合打分结果,并进行肽段到蛋白质的推断,得蛋白质鉴定结果,采用并行处理的方式显著提高蛋白质序列数据库搜索鉴定效率。

著录项

  • 公开/公告号CN110277136A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-09-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 湖南大学;

    申请/专利号CN201910604573.8

  • 申请日2019-07-05

  • 分类号G16B20/00(20190101);G16B50/30(20190101);G01N33/68(20060101);

  • 代理机构44224 广州华进联合专利商标代理有限公司;

  • 代理人黄晶晶

  • 地址 410001 湖南省长沙市岳麓区麓山南路麓山门

  • 入库时间 2024-02-19 13:40:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-10-22

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/00 申请日:20190705

    实质审查的生效

  • 2019-09-24

    公开

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