用于基于规则的基因组设计的方法

摘要

本文描述了用于设计、测试和验证基因组设计的方法和系统。计算机实施的方法包括，接收已知基因组和等位基因列表的数据，鉴定和去除已知基因组中各等位基因的出现，确定用于替换已知基因组中出现的多个等位基因选择，基于已知基因组产生基因组设计的多个替代性基因序列，通过为各替代性基因序列中各规则或约束或条件或参数或特征分配评分，将多个规则或约束或条件或参数或特征应用于各替代性基因序列，产生评分，基于评分的加权组合，对各替代性基因序列进行评分，并基于评分选择至少一个替代性基因序列作为基因组设计。