A New Data Processing Method System Construction for Expressed Sequence Tags Based on cDNA Termini

摘要

本文是和美国迈阿密大学植物系梁春博士（Dr.ChunLiang）合作，对EST序列的处理方法及平台构建进行深入研究和探索后得到的成果。目前，已经有许多其它EST序列预处理软件广泛的应用于EST序列的处理之中，但是目前所有这些EST序列预处理软件都有一个共同的缺点，就是忽略了cDNA的文库构造过程中所形成的终端及其结构信息，导致目前经过这些EST序列预处理软件得到的相当一部分EST序列存在信息污染、信息缺失、数据不完整及数据不一致等一系列问题，这些存在以上问题的EST数据源将影响到EST序列的后续分析和处理，甚至得出错误的结论。EST序列中的终端特征是标识cDNA片段在EST序列中的位置的重要信...