Genome Annotation for Eukaryotes and Analysis of Prokaryote Genome Sequencing Data

摘要

生物按照细胞类型分类有真核生物与原核生物，本文主要从真核生物与原核生物两个角度研究生物信息领域的意义所在。 随着高通量测序技术的发展，大量物种被测序并装配获得基因组序列。然而，如何快速准确地注解真核基因组的结构仍然是一个重要问题。目前注解一个真核基因组需要大量来源可靠、不同类型的参考数据源，例如相同或近似物种的蛋白质序列、EST、cDNA序列以及RNA-Seq数据。收集大量可靠的数据，并整合不同数据的分析结果，获得一致、完整的注解结果是一项耗时复杂的工作。因此，本研究第一部分提出一种快速便捷的计算工具GASS，利用相似物种的注解信息来完成一个新物种基因组的结构注解。首先将相似物种的外显子序列...