Genome Sequencing and Analyses of Deep-sea PAH-degrading Bacterium Cycloclasticus sp. P1

摘要

Cycloclasticussp.P1是本实验室从西太平洋深海沉积物中富集分离得到的一株多环芳烃（PAHs）降解菌。该菌是第一株从深海环境中分离到的解环菌，也是本属唯一能以芘为唯一碳源生长菌株。本研究通过Roche454测序技术对全基因组草图进行测序，并通过PCR扩增和ABI3730测序技术对其进行genomefinishing，最终获得了该菌完整的基因组序列。Cycloclasticussp.P1基因组由一个长2，363，137bp的环状染色体构成，GC含量42%。全基因组共编码2342个开放阅读框（ORF），其中1709个orf编码有确定功能的蛋白，24个未知功能蛋白，149个orf编码推...