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Diversidad de las comunidades de bacterias y hongos en suelos de cultivos de cacao (Theobroma cacao L.) y café (Coffea arábica) bajo manejo orgánico y convencional

机译:有机和常规管理下可可豆和可可豆咖啡土壤中细菌和真菌群落的多样性

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摘要

En el suelo habitan una gran cantidad de organismos que desarrollan diversas funciones ecológicas, muchas de las cuales son importantes para el crecimiento y desarrollo de las plantas. De estas especies menos del 1% han sido cultivadas o caracterizadas, siendo el suelo uno de los ecosistemas más diversos y menos estudiados del planeta. Para comprender y aprovechar los efectos favorables de los microorganismos del suelo, es necesario primero conocerlos y caracterizarlos. El presente estudio se realizó, con el objetivo de determinar si existen diferencias entre la diversidad y estructura de las comunidades microbianas del suelo en cultivos de cacao y café manejados de forma orgánica y convencional. El trabajo se llevó a cabo analizando 6 pares de muestras de suelo en los primeros 10 cm de la zona rizosférica, a partir de las cuales se extrajo el ADN metagenómico. Fragmentos de ADN ribosomal 16S (de bacterias) y de la región ITS (de hongos) fueron amplificadas por PCR, con cebadores universales. Además, mediante la técnica de DGGE se obtuvieron imágenes de los perfiles de diversidad. A partir de estos perfiles, se estimaron índices de diversidad y las estructuras de las comunidades bacterianas y fúngicas de las muestras, fueron comparadas usando análisis de agrupamiento jerárquicos. Los resultados obtenidos no muestran diferencias significativas a nivel de las comunidades microbianas ni tampoco en las propiedades físico-químicos entre los dos sistemas de manejo evaluados.
机译:在土壤中生活着许多具有各种生态功能的生物,其中许多对于植物的生长和发育很重要。在这些物种中,只有不到1%的物种得到了培养或鉴定,土壤是地球上种类最多,研究最少的生态系统之一。要了解和利用土壤微生物的有益作用,有必要首先了解和表征它们。进行本研究的目的是确定在以有机方式和常规方式管理的可可和咖啡作物中,土壤微生物群落的多样性和结构之间是否存在差异。这项工作是通过分析根际区前10 cm的6对土壤样品来提取宏基因组DNA的。用通用引物通过PCR扩增16S核糖体DNA(来自细菌)和ITS区域(来自真菌)的片段。此外,使用DGGE技术,获得了多样性分布图的图像。根据这些概况,可以估算多样性指数,并使用分层分组分析比较样品的细菌和真菌群落的结构。所获得的结果在两种评估的管理体系之间在微生物群落水平或理化特性上均未显示出显着差异。

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