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Entwicklung und Evaluierung molekularbiologioscher Nachweismethoden zur Spezies- und OspA-Typ-Differenzierung von Borrelia burgdorferi sensu lato

机译:Borrelia burgdorferi sensu lato物种分子生物学检测方法的发展与评价及Ospa型分化

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摘要

Die Lyme-Borreliose, ausgelöst durch den Erreger B. burgdorferi s.l., ist die häufigste von Zecken übertragene Infektionserkrankung der nördlichen Hemisphäre. Der B. burgdorferi s.l. Komplex besteht mittlerweile aus mindestens elf definierten Spezies. In Europa ist für die drei Spezies B. burgdorferi s.s., B. afzelii und B. garinii eine Humanpathogenität gesichert, für B. valaisiana wird sie zumindest vermutet. Anhand des Oberflächenproteins OspA wurden für Europa mindestens sieben verschiedene OspA-Typen definiert. Die Spezies B. burgdorferi s.s. und B. afzelii sind homogen in ihrem OspA-Typ und entsprechen Typ 1 und 2. Die Spezies B. garinii hingegen ist wesentlich heterogener und lässt sich in fünf OspA-Typen (3 bis 7) differenzieren. Die Heterogenität der Borrelien in Europa hat wichtige Implikationen für die Pathogenitätsforschung (u. a. Organotropsimus), da verschiedene Spezies bzw. OspA-Typen möglicherweise mit unterschiedlichen klinischen Manifestationsformen der Lyme-Borreliose assoziiert sind. Außerdem beeinflusst die Heterogenität maßgeblich die Entwicklung von einem europäischen Impfstoff und von diagnostischen und epidemiologischen Testsystemen. Valide Daten zur Verteilung der Spezies und OspA-Typen sind somit Vorraussetzung für derlei Entwicklungen. Jedoch ist das bisher vorhandene Datenmaterial, besonders in Bezug auf die Verteilung der OspA-Typen, sehr begrenzt, was möglicherweise auch an dem hohen Aufwand und den Kosten bisher beschriebener Differenzierungsmethoden liegt.Im Rahmen dieser Arbeit wurden einfache und zuverlässige OspA-PCR basierende Methoden entwickelt die einen sensitiven Nachweis und eine Differenzierung aller in Europa relevanten B. burgdorferi s.l. Spezies erlauben. Im Gegensatz zu vielen bisher veröffentlichten PCR Protokollen wurde die Sensitivität der Methoden mit einem umfangreichen Panel von 9 B. burgdorferi s.l. Stämmen der verschiedenen Subtypen evaluiert und die Spezifität durch Testung von 18 verwandten Spirochäten abgesichert. Nur so kann bei der Heterogenität der Borrelien die Sensitivität und Spezifität einer PCR ausreichend evaluiert werden. Die hier entwickelte RFLP Analyse erlaubt eine Differenzierung aller in Europa relevanten Spezies und zusätzlich der fünf OspA-Typen von B. garinii. Sie stellt somit ein ideales Werkzeug für notwendige epidemiologische Untersuchungen zur Heterogenität von B. burgdorferi s.l. in Europa dar. Im Weiteren ist, im Gegensatz zu vielen etablierten Typsisierungsmethoden, eine zuverlässige Differenzierung von Doppelinfektionen möglich, wie sie in Zecken und klinischem Material schon mehrfach beschrieben sind. Die entwickelte Multiplex-PCR erlaubt eine schnelle und sehr einfache Differenzierung der klinisch relevanten Spezies B. burgdorferi s.s., B. afzelii, B. garinii und B. valaisiana in einem Reaktionsansatz. Sie stellt das erste beschriebene Multiplex-PCR-Protokoll zur Differenzierung von B. burgdorferi s.l dar. Der LightCycler ist eine schnelle, moderne real-time-PCR Methode. In der vorliegenden Arbeit wurde erstmals ein LightCycler-Protokoll entwickelt, das eine Differenzierung der in Europa relevanten Spezies und mit Einschränkungen auch der verschiedenen OspA-Typen von B. garinii erlaubt.In einer Pilotstudie wurde die Verteilung von Borrelia-Spezies und OspA-Typen in Zecken und in klinischem Material untersucht. Die Borrelienpopulationen aus den Zecken der verschiedenen Sammelgebiete zeigten eine ausgeprägte Mikro- und Makroheterongenität, wobei aufgrund der Inkonstanz der Verteilungsmuster über die Zeit keine lokalen Vorhersagen über das Vorkommen einzelner Subtypen gemacht werden konnten. Ein interessanter Befund war die hohe fokale Prävalenz von OspA-Typ 4 in einem Gebiet, da diesem OspA-Typ möglicherweise eine herausragende pathogenetische Bedeutung zukommt und er bisher nur selten in Zecken gefunden wurde. Die Differenzierung von Borrelien aus klinischem Material erlaubt Rückschlüsse auf wichtige pathogenetische Zusammenhänge und Assoziationen. Bei den durchgeführten Untersuchungen konnte eine Assoziation von B. afzelii mit kutanen Manifestationen der Lyme-Borreliose bestätigt werden. Bei der Differenzierung von Isolaten von Patienten mit Neuroborreliose zeigte sich wie schon in vorangegeangenen Studien eine Dominanz der Spezies B. garinii und auf der Ebene der OspA-Typen Verteilung interessante Unterschiede in der in Bezug auf das Alter der untersuchten Patienten.Insgesamt wurde in dem untersuchten Material neben B. burgdorferi s.s., B. afzelii, B. valaisiana und allen fünf OspA-Typen von B. garinii auch die Genospezies Borrelia A14S sowie B. bissettii detektiert. Borrelia A14S stellt eine erst kürzlich beschriebene neue Genospezies von B. burgdorferi s.l. dar, deren Verteilung in Europa noch weitgehend unbekannt ist. Der Nachweis von B. bissettii aus einer Liquorprobe ist die erste Beschreibung dieser Spezies in Deutschland und wirft Fragen über ihre - bisher vermutete - Apathogenität auf. Die erhaltenen Prävalenzdaten der verschiedenen Borrelien stellen einen Schritt zur Erarbeitung einer epidemiologischen Basis für die Entwicklung eines zuverlässigen Impfstoffs und diagnostischer und epidemiologischer Testsysteme in Europa dar. Aufgrund der Unterschiede der Borrelienpopulationen in verschiedenen geographischen Regionen sind hierfür aber weitere breitgefächerte Untersuchungen auf dem ganzen Kontinent nötig. Die in dieser Arbeit entwickelten, breit evaluierten und einfachen durchzuführenden Methoden stellen für derlei Untersuchungen eine praktikable methodische Basis dar.
机译:由病原体B. burgdorferi s.l.引起的莱姆病是北半球最常见的tick传传染病。伯氏芽孢杆菌现在,复合体至少包含11种已定义物种。在欧洲,B。burgdorferi s.s.s.,B。afzelii和B. garinii三种具有人类致病性,至少怀疑它对瓦莱亚种(B. valaisiana)有影响。根据表面蛋白OspA,欧洲至少定义了7种不同的OspA类型。 B.burgdorferi s.s.种B. afzelii和B. afzelii在OspA类型上是同质的,并分别对应于类型1和2。然而,B。garinii物种的异质性要高得多,可以分为5种OspA类型(3至7)。由于不同的物种或OspA类型可能与莱姆病的不同临床表现相关,因此欧洲疏螺旋体的异质性对致病性研究(包括嗜有机营养)具有重要意义。此外,异质性还极大地影响了欧洲疫苗以及诊断和流行病学测试系统的发展。因此,有关物种和OspA类型分布的有效数据是此类发展的前提。然而,迄今为止可获得的数据非常有限,尤其是关于OspA类型的分布,这可能是由于迄今为止描述的分化方法花费了大量的精力和精力,在此过程中开发了基于OspA-PCR的简单可靠的方法它提供了敏感的证据并区分了欧洲所有相关的伯氏疏螺旋体允许物种。与迄今公开的许多PCR方案相反,该方法的敏感性使用广泛的9 B.burgdorferi s.l.评估。对不同亚型的菌株进行评估,并通过测试18个相关螺旋体来验证特异性。考虑到疏螺旋体的异质性,这是充分评估PCR灵敏度和特异性的唯一方法。此处开发的RFLP分析可以区分欧洲所有相关物种,也可以区分来自加倍芽孢杆菌的五种OspA类型。因此,它是进行伯氏疏螺旋体异质性必要流行病学研究的理想工具。此外,与许多公认的分型方法相比,双重感染的可靠区分是可能的,正如在tick和临床资料中已多次描述的那样。所开发的多重PCR允许在一个反应​​中快速且非常容易地区分临床相关物种伯氏疏螺旋体,非洲假单胞菌,加氏假单胞菌和瓦氏芽孢杆菌。它代表了首次描述的用于区分伯氏疏螺旋体的多重PCR协议。LightCycler是一种快速,现代的实时PCR方法。在当前的工作中,首次开发了LightCycler协议,该协议可以区分欧洲相关物种,并有限制地区分与gar.ii和B. garinii不同的OspA类型。虫并在临床材料中进行检查。来自各个采集区the的伯氏疏螺旋体种群表现出明显的微观和宏观异质性,由于分布模式随时间的不一致,无法对单个亚型的发生做出局部预测。一个有趣的发现是某个区域中OspA 4型的高局灶性患病率,因为该OspA型可能具有突出的致病学意义,并且迄今为止在tick中很少发现。疏螺旋体与临床材料的区别使得可以得出有关重要的致病关系和关联的结论。在进行的研究中,证实了非洲双歧杆菌与莱姆病的皮肤表现有关联。与以前的研究一样,当从患有神经硼蛋白缺乏症的患者中分离出分离株时,B。garinii菌在OspA类型分布水平上的优势地位与所检查患者的年龄之间存在显着差异除了B. burgdorferi s,B。afzelii,B。valaisiana以及来自B. garinii的所有五种OspA类型,还检测到了Borrelia A14S和Bs bissettii属。伯氏疏螺旋体A14S代表最近描述的伯氏疏螺旋体的新基因型。代表其分布在欧洲仍是未知数。从脑脊液样本中检测到比斯氏芽孢杆菌是该物种在德国的首次描述,并引起了对其先前怀疑的无病性的质疑。在欧洲获得的流行病数据代表了建立流行病学基础以发展可靠的疫苗以及诊断和流行病学测试系统的步骤。但是,由于不同地理区域中的伯雷利亚病人群存在差异,因此有必要在整个非洲大陆进行广泛基础的研究。在这项工作中开发,广泛评估和易于执行的方法代表了此类研究的实用方法论基础。

著录项

  • 作者

    Michel Holger;

  • 作者单位
  • 年度 2005
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