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Identifikation signaltransduktionsrelevanter Gene in Melanom-zelllinien durch Entwicklung und Anwendung eines Verfahrens zur Analyse von Daten aus cDNA-Hybridisierungsarrays

机译:通过开发和应用分析来自cDNa杂交阵列的数据的方法鉴定黑素瘤细胞系中的信号转导相关基因

摘要

Mit speziell angefertigten cDNA-Makro-Arrays wurden Melanomzelllinien und kulti-vierteMelanozyten auf die transkriptionelle Aktivität von Genen untersucht, welchebekannterweise bei der zellulären Signaltransduktion von Bedeutung sind. ZurAnalyse der daraus erhaltenen Daten wurde das Computer-Programm "GeneFish"geschrieben, welches auch für zukünftige, ähnliche Fragestellungen in anderenSystemen verwendbar ist. Mit Hilfe dieses Programmes wurde gefunden, dass beiADAM-9, ADAM-10, HER3, FAK, SHC und dem IGF-1-Rezeptor die Unterschiededer Expression zwischen Melanomzelllinien und Melanozyten besondersausgeprägt waren. Bei weiteren Genen wurden schwächer ausgeprägte, jedochebenfalls interessante Expressionsmuster beobachtet.Die Rolle von HER3 wurde durch Einführung einer dominant negativ wirkendenMutante von HER3 in Melanomzelllinien weitergehend untersucht. BeiVerwendung eines konstitutiv exprimierenden Expressionssystems starben dietransgenen Zellen, was einem lethalen Effekt der Mutante zugeschrieben wurde.Mit einem induzierbaren Expressionssystem wurden Zellklone erhalten, dieveränderte biologische Eigenschaften aufwiesen, welche jedoch unabhängig vonder Expression des Transgens waren. Trotz dieser technischen Schwierigkeitbleibt HER3 eines der vielversprechendsten Gene für die künftige Forschung anMelanomen.
机译:使用专门设计的cDNA宏阵列,检查了黑素瘤细胞系和培养的黑素细胞的基因转录活性,这些基因在细胞信号转导中很重要。为了分析从中获得的数据,编写了计算机程序“ GeneFish”,该程序也可以用于将来其他系统中的类似问题。在该程序的帮助下,发现黑素瘤细胞系和黑素细胞之间的表达差异在ADAM-9,ADAM-10,HER3,FAK,SHC和IGF-1受体中尤为明显。对于其他基因,观察到表达模式不太明显但也很有趣,通过在黑素瘤细胞系中引入HER3显性负突变进一步研究了HER3的作用。使用组成型表达系统,转基因细胞死亡,这归因于突变体的致死作用;使用诱导型表达系统,获得了生物学特性已改变但与转基因表达无关的细胞克隆。尽管存在技术难题,HER3仍然是未来黑色素瘤研究中最有前途的基因之一。

著录项

  • 作者

    Lankenau Andreas;

  • 作者单位
  • 年度 2001
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