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Epidemiología molecular de la tuberculosis en bogotá en aislados clínicos obtenidos durante 11 años

机译:11年来获得的临床分离株波哥大结核病的分子流行病学

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摘要

Objetivo Tipificar molecularmente aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis obtenidas en Bogotá entre los años 1995 a 2006, mediante la técnica RFLP-IS6110 para establecer las relaciones filogenéticas existentes entre ellos y determinar casos debidos a infección reciente (casos agrupados) Vs reactivaciones endógenas (patrones únicos).Métodos Se realizó un estudio retrospectivo, en el que se incluyeron 137 aislados clínicos pertenecientes al complejo Mycobacterium tuberculosis, obtenidos en Bogotá entre los años 1995 a 2006. Las variables estudiadas para cada paciente fueron: sexo, edad, confección con el Virus de la Inmunodeficiencia Humana, habitante en situación de calle, resultado de la baciloscopia, fecha del cultivo. Los aislados fueron identificados fenotípicamente y confirmados genotípicamente mediante el método molecular PRA y evaluados para sensibilidad a fármacos antituberculosos de primera línea utilizando el método simplificado de las proporciones múltiples. La genotipificación se realizó empleando el método de referencia RFLP-IS6110 (Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos de restricción).Resultados Todos los aislados fueron confirmados como pertenecientes al complejo M. tuberculosis, mostrando la identificación fenotípica una concordancia del 100 % con la identificación genotípica. La monorresistencia encontrada fue de 9,4 %, y la MDR (resistencia a Rifampicina e Isoniazida) fue 2,9 %. La genotipificación se realizó a 129 aislados, de los cuales 96 (74 %) mostraron diferentes patrones RFLP-IS6110 y 35 aislados (26 %) estuvieron agrupados en 17 clusters conformados por 2 a 4 aislados. La relación epidemiológica entre los pacientes no pudo ser establecida en la mayoría de los casos. De las variables estudiadas solamente el estado de coinfección con VIH fue un predictor significativo para el agrupamiento (p0.05).Conclusión Los resultados de nuestro estudio muestran un alto porcentaje de genotipos con patrones RFLP-IS6110 únicos, lo que sugiere gran variabilidad genética entre los aislados de M. tuberculosis circulantes en Bogotá, indicando que la mayoría de los casos de tuberculosis en el estudio pueden ser atribuibles a reactivaciones endógenas.
机译:目的使用RFLP-IS6110技术对1995年至2006年在波哥大获得的结核分枝杆菌的临床分离株进行分子分型,以建立它们之间的系统发育关系,并确定近期感染(分组病例)与内源性再激活(独特模式)的病例方法进行了一项回顾性研究,其中包括1995年至2006年之间在波哥大获得的137例结核分枝杆菌复合体临床分离株,研究对象包括:性别,年龄,病毒的制备方法。人免疫力低下,街道居民,细菌学检查结果,培养日期。通过PRA分子方法对分离物进行表型鉴定和基因型确认,并使用简化的多比率方法评估对一线抗结核药物的敏感性。结果:参照片段RFLP-IS6110(限制性片段长度多态性)进行基因分型,结果证实所有分离物均属于结核分枝杆菌复合物,其表型鉴定与鉴定结果具有100%的一致性。基因型。测得的单抗为9.4%,MDR(对利福平和异烟肼的抗性)为2.9%。对129个分离株进行基因分型,其中96个(74%)显示出不同的RFLP-IS6110模式,35个分离株(26%)被分组为17个簇,由2-4个分离株组成。大多数情况下无法确定患者之间的流行病学关系。在研究的变量中,只有HIV合并感染状态是该组的重要预测指标(p <0.05)结论我们的研究结果显示,具有独特RFLP-IS6110模式的基因型百分比很高,表明两者之间存在很大的遗传变异性。结核分枝杆菌在波哥大流通,这表明该研究中大多数结核病例都可归因于内源性激活。

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