Új tömegspektrometriás módszerek kifejlesztése és alkalmazása a peptid- és fehérjekutatásban = Development and application of mass spectrometric techniques for the analysis of peptides and proteins

摘要

Kutatásaink során peptidek, proteinek, polilizinek és molekuláris komplexek tömegspektrometriás vizsgálatával foglalkoztunk. Molekuláris komplexek körében mind szolvatált fémionokkal, mind pedig antitest-antigén komplexekkel foglalkoztunk, ezeket sikeresen előállítottunk és tömegspektrometriával jellemeztünk. Legfontosabb eredményünk egy olyan új peptidfragmentációs modell kidolgozása, mely peptidek tömegspektrumának, tandem tömegspektrumának elméleti meghatározását teszi lehetővé. A modell alapján egy olyan új szoftvert fejlesztettünk ki, mely a világon egyedülálló, prediktív jellegű és a gyakorlatban jól használható. A modell "szemi-empirikus" megoldás: az elméleti, általunk kifejlesztett MassKinetics algoritmus alapján működik, a fragmentáció leírásához szükséges fizikai, fiziko-kémiai paramétereket viszont empirikusan meghatározott paraméterekkel helyettesíti. A program a proteomika eszköztárát jelentősen továbbfejleszti, szabadalmaztatást követően világszerte elérhetővé tesszük. | We have studied peptides, proteins, polylysins and various molecular complexes by mass spectrometry. In the latter class we have produced and characterized both solvated metal ions and antibody-antigen complexes. Our most important result is development of a new peptide fragmentation model which allows theroretical prediction of tandem mass spectra. Based on this model a new software has been developed which is unique, has predictive value and can be used easily. It is a "semi-empirical" method, as it is based on the theoretical MassKinetics algorithm, but the physical and physico-chemical parameters needed to describe peptide fragmentation are determined by an empirical approach. The program can be advantageously used in the proteomics field and will be made widely available after patenting.