Sertés-, és baromfi-pathogén E. coli törzsek mobilis virulencia-génjeinek vizsgálatára irányuló kutatások és ezek hasznosítása a védekezésben = Investigations on the mobile virulence genes of porcine and poultry pathogenic E. coli strains, its application in the protection

摘要

Terveinkkel összhangban elvégeztük az EC2173 jelű sertés enteroxoikus E. coli (ETEC) törzs pTC virulencia- és rezisztencia-plazmidjának szekvenálását. 2008 07. 11.-én bírálatra benyújtva a Journal of Clinical Microbiology -hoz (JCM01317-08_1). Előzetes terveinken felül (sertés enterotoxikus E. coli törzsek mobilis virulencia elemeinek vizsgálata) az antibiotikum rezisztenciagének genetikai átviteli lehetőségei is érdeklődésünk középpontjába kerültek. Ezért hazai élelmiszer eredetű E. coli és Salmonella törzseken megkezdtük az SGI1 (Salmonella Genomic Island 1) mobilis antibiotikum rezisztenciaelem vizsgálatát. Pulsed-field gél elektroforézissel feltártuk 17 SGI1 hordozó, élelmiszer eredetű S. Typhimurium törzs filogenetikai kapcsolatát. Az SGI1 gazdakromoszómából való kivágódását az attB integrációs hely szekvencia kimutatásával végeztük. A fenti 17 Typhimurium törzsben az SGI1 fennmaradását valamint különféle rezisztencia-variánsok létrejöttét szegregációs analízisben (az antibiotikum-rezisztencia kép változásának követésével) számos passzálási lépés után vizsgáltuk. A létrejött szegregánsokban az SGI1 bal- és jobb határoló régiója PCR vizsgálatokban ép volt, jelezve, hogy a rezisztencia háttér változásai az SGI1 szigeten belüli deléciós események következményei lehetnek. | According to our plans we determined and analysed the full sequence of the pTC virulence- and antibiotic-resistance plasmid of the EC2713 porcine enterotoxigenic E. coli (ETEC) strain. Submitted to the Journal of Clinical Microbiology (JCM01317-08_1) on 07. 11. 2008. Beyond our original plans (characterisation of the mobile virulence elements of porcine ETEC strains) we started to investigate the genetic transfer possibilities of the antibiotic resistance genes. We investigated the presence of the SGI1 (Salmonella Genomic Island 1) mobile resistance element among Hungarian E. coli and Salmonella starins. Using pulsed-field gel electrophoresis we determined the genetic relationship between the isolated 17 SGI1 positive S. Typhimurium strains. Among these strains, the excision of the SGI1 form the host chromosome was found by PCR specific for the attB integration site. The stability of the SGI1 and generation of new resistance variants was determined by segregational analysis (by screening the changes in the resistance pattern) in several passage steps. Int he new segregants the left- and right flanking region of the SGI1 were found intact in PCR assays, indicating that the changes of the resistance pattern are generated by internal deletional events in the SGI1.