Erdei fákon kórokozó Phytophthora fajok molekuláris azonosítása = Molecular identification of Phytophthora species pathogenic on forest trees

摘要

Előző kutatásaink során beteg és pusztuló erdei fákról több mint 300 Phytophthora izolátumot tartalmazó törzsgyűjteményt hoztunk létre. Az izolátumok morfológiai azonosítása nem minden esetben vezetett eredményre. A molekuláris azonosítást a riboszomális RNS-t kódoló gén (rDNS) ITS1 és ITS2 szakaszainak nukleotid sorrendje alapján végeztük el a következők szerint: DNS kivonása a micéliumból, PCR amplifikáció specifikus indítószekvenciák alkalmazásával, a PCR termék szekvenálása, összehaonlítása a GenBank adatbázisban levő ismert szekvenciákkal, statisztikai elemzés. Hat Phytophthora fajt határoztunk meg, továbbá öt olyan haplotípust különítettünk el, amelyek még le nem írt taxonokat képviselnek. A meghatározott fajok és gazdanövényeik a következők: Phytophthora alni: Alnus glutinosa Phytophthora cactorum: Juglans nigra Phytophthora citricola: Alnus glutinosa, Juglans nigra, Quercus cerris, Quercus petraea Phytophthora gonapodyides: Alnus glutinosa, Quercus petraea Phytophthora inundata: Alnus glutinosa Phytophthora megasperma: Alnus glutinosa Eredményeink e Phytophthora fajok izolálásának és azonosításának első magyarországi adatai. A megvizsgált hazai izolátumok az ITS szekvenciákra épült filogenetikai törzsfa négy fő ágához tartoznak. A P. citricola és a P. gonapodyides esetében nagy fajon belüli változékonyságot mutattunk ki. | A collection of more than 300 isolates of Phytophthora spp. was established previously from symptomatic forest trees in several locations of Hungary. The identification of the isolates presented difficulties because of the insufficiency of adequate morphological characters. Molecular identification was performed by sequencing the ITS1 and ITS2 regions of the ribosomal DNA and comparing with the known Phytophthora sequences accessible in GenBank. Six Phytophthora species have been determined and further five haplotypes delimited representing undescribed, potentially new taxa. The list of the identified species and their hosts: Phytophthora alni - Alnus glutinosa Phytophthora cactorum - Juglans nigra Phytophthora citricola - Alnus glutinosa, Juglans nigra, Quercus cerris, Q. petraea Phytophthora gonapodyides -Alnus glutinosa, Quercus petraea Phytophthora inundata - Alnus glutinosa Phytophthora megasperma - Alnus glutinosa These are the first data of isolation and determination of Phytophthora species in forest trees in Hungary. The statistical processing showed that the investigated Hungarian isolates belong to four major clada of the phylogenetic tree built on the ITS sequences. Large intraspecific variability was found in P. citricola and P. gonapodyides.