Környezetkímélő mezőgazdasági eljárások biotechnológiai alapjai = Biotechnological approaches supporting environmentally friendly agricultural technologies

摘要

A kalászfuzáriózis kórokozóinak PCR-dianosztikán alapuló azonosítása és a meteorológiai adatgyűjtésen alapuló elemzés igazolta, hogy a klasszikus Fusarium járványmodell magyarországi viszonyok között nem érvényesül. Nálunk másodlagos gombafertőzés okozza a betegséget, és ez vezethet mikotoxin szennyeződéshez. A komposztlakó Trichoderma nemzetség tagjait összetett lignocellulózbontó enzimrendszer jellemzi; a szinergista kölcsönhatásban együttműködő enzimek biztosítják a mezőgazdasági hulladékok különösen hatékony reciklizációját. Homológia modellezéssel három CMV-izolátum (Trk7,R,M) köpenyfehérje -szerkezetét készítettük el, majd ezeknek a modelleknek a felhasználásával értelmeztük azt, hogy a köpenyfehérje egy-egy aminosavának változása miért okozhat jelentős változásokat a tünetek fenotípusában, illetve a gazdanövénykörben. A CP-térszerkezet és a tünetek összefüggéseit vizsgálva elmondhatjuk, hogy a 129-es aminosavval kezdődő βE-αEF hurok mozgékonyságának döntő szerepe van a tünetek kialakításában, bár önmagában ez a jellemző nem meghatározó. Továbbá minden vizsgált mutáció esetén a jósolt foszforilációs hely változása következik be, így valószínűsíthető hogy a köpenyfehérje foszforilációjának döntő szerepe van a gazdanövény válaszreakciójában. A hibrid potyvírusok köpenyfehérjéinek kicserélése rámutatott azok szerepének a vírus által indukált betegségtünet fenotípusának kialakulásában. | PCR-based diagnostic detection of Fusarium ear blight (FEB) pathogens and analysis of weather factors indicated that the classical model of FEB infection is absent under Hungarian conditions. A secondary fungal infection is responsible for this disease and mycotoxin contamination in wither wheat. The lignocellulose degrading enzymes of Thermobifida, a group of compost inhabiting actinomycetes form a highly complex synergistically interacting system allowing the most efficient recycling of agricultural wastes. Models of cucumovirus CPs were built by the MODELLER program. Model refinements were carried out using the Kollman molecular mechanical force field. Models were analyzed by the PROCHECK programs. Electrostatic potential calculations were applied to all models and a functional site searching was performed with the contribution of the PROSITE software. We found that high flexibility of the βE-αEF loop starting with the residue 129 is required, but it is not sufficient for the symptom appearance. Furthermore, phosphorylation of the CP is prospective to be important in the host response mechanism. All analyzed mutations were related to the modifications of the predicted phosphorylation sites. Study with hybrid potyviruses clearly proved the role of CP in disease symptom phenotype.