Komplex hálózatok a molekuláris biológiai szabályozásban = Complex networks in molecular biological regulation

摘要

A projektben molekuláris biológiai szabályozási hálózatok elemzését végeztük számítógépes biológiai (bioinformatikai) eszközökkel. Az első vizsgált szabályozási hálózat típus rövid szabályozó RNS-ek (mikroRNS-ek) és messenger RNS-ek kapcsolatait írja le, a második vizsgált hálózat típus sejten belüli jelátviteli kölcsönhatásokat ír le. Az első esetben azonosítottunk együtt szabályozó mikroRNS-ekből álló modulokat, és javaslatot tettünk konkrét kísérletekre, amelyekkel megállapítható, hogy az egyes mikroRNS-ek az emberi sejtek számára mennyire nélkülözhetőek. A második esetben összeállítottunk egy jelátviteli útvonal adatbázist, javaslatot tettünk (fontossági/szignifikancia sorrendben) új gyógyszer célpont fehérjékre. Továbbá előrelejeztünk a hálózatban résztvevő újabb fehérjéket, amelyek közül 6 fehérjére az előrejelzést kísérletekkel ellenőrizték társszerzők az ELTE Genetika tanszékén. | In this project we have analyzed molecular biological regulatory networks with computational biological tools. The first type of analyzed regulatory networks contains interactions between short regulating RNAs (microRNAs) and messenger RNAs, while the second type of regulatory networks contains intracellular signaling pathways. In the first case we have identified modules (groups) of microRNAs with highly similar regulatory tasks within each group, and proposed experiments to determine the relative level of dispensability of each human microRNA. In the second case have compiled a resource of intracellular signaling pathways and suggested (in order of significance) novel drug target proteins. Moreover, we have predicted novel pathway member proteins, of which 6 have been experimentally verified by co-authors at the Department of Genetics at Eotvos University