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Accelerating electrostatic pair methods on graphical processing units to study molecules in supercritical carbon dioxide

机译:在图形处理单元上加速静电对方法以研究超临界二氧化碳中的分子

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摘要

Traditionally, electrostatic interactions are modelled using Ewald techniques, which provide a good approximation, but are poorly suited to GPU architectures. We use the GPU versions of the LAMMPS MD package to implement and assess the Wolf summation method. We compute transport and structural properties of pure carbon dioxide and mixtures of carbon dioxide with either methane or difluoromethane. The diffusion of pure carbon dioxide is indistinguishable when using the Wolf summation method instead of PPPM on GPUs. The optimum value of the potential damping parameter, α, is 0.075. We observe a decrease in accuracy when the system polarity increases, yet the method is robust for mildly polar systems. We anticipate the method can be used for a number of techniques, and applied to a variety of systems. Substitution of PPPM can yield a two-fold decrease in the wall-clock time.
机译:传统上,静电相互作用是使用Ewald技术建模的,该技术可以提供很好的近似值,但不适用于GPU架构。我们使用LAMMPS MD软件包的GPU版本来实现和评估Wolf求和方法。我们计算纯二氧化碳以及二氧化碳与甲烷或二氟甲烷的混合物的传输和结构性质。当使用Wolf求和方法代替GPU上的PPPM时,纯二氧化碳的扩散是无法区分的。电位阻尼参数α的最佳值为0.075。我们观察到当系统极性增加时精度会降低,但是该方法对于弱极性系统是可靠的。我们预计该方法可用于多种技术,并应用于多种系统。替换PPPM可使挂钟时间减少两倍。

著录项

  • 作者

    Baker J.A.; Hirst J.D.;

  • 作者单位
  • 年度 2014
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 en
  • 中图分类

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