Estudo do efeito 'rizosfera' nas comunidades de Archaea em plantas de mangal

摘要

Os mangais são económica e biologicamente importantes. Sendo, contudo, cada vez mais ameaçados. Com o intuito de recuperar estesecossistemas, têm sido desenvolvidos programas de reabilitação. Todavia,geralmente, estes programas não consideram a importância e os possíveis efeitos das interacções entre microrganismos e plantas no ecossistema dos mangais, devido ao número limitado de estudos em ecologia microbiana neste ecossistema. Sabe-se que as raízes de espécies de plantas terrestresinfluenciam a composição das comunidades bacterianas do solo. Por sua vez, os microrganismos podem contribuir no crescimento e saúde das plantas. Esteestudo teve como objectivos desenvolver um sistema primers para reacção emcadeia da polimerase -electroforese em gel com gradiente desnaturante (PCRDGGE)para o domínio Archaea e o género Nanoarchaeum e determinar se asraízes de plantas de mangal (Rhizophora mangle e Laguncularia racemosa)afectam a composição das comunidades de Archaea e Nanoarchaeum quehabitam o solo que está sob a influência das raízes de mangal (efeito“rizosfera”).As comunidades de Archaea e Nanoarchaeum foram analisadas por métodos moleculares, como a PCR e o DGGE. Foi desenvolvido um sistema de primers para PCR-DGGE adequado para o domínio Archaea e para ogénero Nanoarchaeum com base em novas sequências do gene 16S rRNArecentemente publicadas. Os perfis de DGGE foram analisados com a análisede similaridades (ANOSIM), o método de escalonamento multidimensional nãoparamétrico (MDS) e o índice de Shannon-Wiener. Os resultados de MDS eANOSIM sugerem que existem diferenças significativas entre as amostras desedimento e as amostras de rizosfera de R. mangle e L. racemosa. Por suavez, a análise de MDS sugere que as raízes de L. racemosa afectam mais acomposição da comunidade de Archaea do sedimento do que as raízes de R.mangle. Pelo contrário, os resultados de MDS e ANOSIM sugerem que asplantas de L. racemosa e R. mangle não exercem qualquer efeito nacomposição de Nanoarchaeum e que não existem diferenças entre asamostras de sedimento e as de rizosfera. A diversidade das populações deArchaea e Nanoarchaeum foi estimada pelo índice de Shannon-Wiener; emostrou que a diversidade de Archaea era mais elevada do que anteriormentedescrito em sedimentos marinhos.Com o propósito de completar este estudo algumas bandas dominantesdas amostras de rizosfera vão ser clonados e sequenciados, vão ser criadasbibliotecas de clones para Nanoarchaeum e serão efectuadas análises depirosequenciação às comunidades de Archaea.