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Uso de brometo de etídeo monoazida e PCR em tempo real para detecção de células viáveis de listeria monocytogenes.

机译:单叠氮化乙溴化乙锭和实时PCR在检测单核细胞增生李斯特菌活细胞中的应用。

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摘要

A análise de PCR em Tempo Real está sendo cada vez mais utilizada para detecção e quantificação de patógenos em amostras de alimentos, uma vez que gera resultados mais rápidos e específicos. A restrição para um uso mais amplo desta técnia é que devido a sua alta sensibilidade, os teste identificam o DNA de células mortas, tornando-o inadequado para fins de diagnóstico. Para contornar este problema tem sido proposto o uso do corante Brometo de Etídeo Monoazida (EMA) para discriminar células viáveis de células mortas. Em estudos preliminares foi verificado que EMA inibe amplificação de células inviáveis de Listeria monocytogenes, por PCR convencional. O objetivo deste estudo foi padronizar a técnica EMA-PCR em Tempo Real para detecção de células viáveis de L. monocytogenes. Foram construídos primers e sonda TaqMan específicos para L. monocytogenes e o gene prfA foi utilizado como seqüência alvo. Foram avaliadas várias espécies de Listeria, sendo que houve amplificação apenas de L. monocytogenes indicando especificidade da amplificação e L. monocytogenes ATCC 7644 foi selecionada para os testes de EMA-PCR. Concentrações variadas de EMA foram adicionadas a microtubos com 108 células viáveis ou inviáveis de L. monocytogenes (tratamento térmico de 98 oC/20 minutos) e estes foram expostos à luz (650 W) por 15 minutos para ativação e fotólise do EMA. Em segida, foi realizada a extração de DNA e PCR em Tempo Real. O DNA foi extraído após tratamentos subseqëntes das células com proteases e fervura. A reação de amplificação foi preparada com TaqMan Universal Master Mix 1X (Applied Biosystem), 250 ng de DNA, 400 nM de cada primer e 400 nM de sonda. A concentração de 6 ug/mL de EMA foi necessária para inibir a amplificação de DNA de células inviáveis de L. monocytogenes sendo que nesta concentração não houve interferência na amplificação de DNA de células viáveis. Após a definição desta concentração, o tratamento das células com 6 ug/mL de EMA foi realizado novamente, porém os microtubos foram expostos à luz por diferentes períodos de tempo para otimização do tempo de exposição à luz. O tempo de 5 minutos foi necessário para a completa fotólise de EMA. A técnica EMA-PCR em Tempo Real apresenta-se como uma ferramenta eficiente na detecção de apenas células viáveis de L. monocytogenes presentes numa amostra.
机译:实时PCR分析越来越多地用于食品样品中病原体的检测和定量,因为它产生更快,更具体的结果。限制该技术广泛使用的限制是由于其高灵敏度,该测试可鉴定死细胞的DNA,使其不适合用于诊断目的。为了克服这个问题,已经提出使用单叠氮化物乙溴化物染料(EMA)来区分活细胞和死细胞。在初步研究中,已证实EMA通过常规PCR抑制了无活力的单核细胞增生李斯特菌细胞的扩增。这项研究的目的是实时标准化EMA-PCR技术,以检测单核细胞增生李斯特氏菌细胞。专为单核细胞增生李斯特氏菌构建引物和TaqMan探针,并将prfA基因用作靶序列。评价了几种李斯特菌,仅扩增了单核细胞增生李斯特氏菌,表明扩增的特异性,并选择了单核细胞增生李斯特氏菌ATCC 7644用于EMA-PCR测试。将不同浓度的EMA添加到具有108个存活或不存活的单核细胞增生李斯特氏菌细胞(98 oC / 20分钟的热处理)的微管中,然后将它们暴露于光(650 W)15分钟以激活和光解EMA。然后,进行DNA提取和实时PCR。在随后用蛋白酶处理细胞并煮沸后提取DNA。用TaqMan Universal Master Mix 1X(Applied Biosystem),250 ng DNA,400 nM每种引物和400 nM探针制备扩增反应。 6 ug / mL的EMA浓度对于抑制不活的单核细胞增生李斯特氏菌细胞的DNA扩增是必需的,在该浓度下,对活细胞的DNA扩增没有干扰。确定浓度后,再次用6 µg / mL EMA处理细胞,但是将微管暴露于不同的时间以优化暴露时间。 5分钟的时间对于EMA的完全光解是必需的。实时EMA-PCR技术本身可作为检测样品中仅存在的单核细胞增生李斯特氏菌细胞的有效工具。

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