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Metaloproteínas y metalómica: Mecanismos de respuesta a metales en diversos organismos modelo, sus interacciones moleculares y su integración en redes metabólicas

机译:金属蛋白和金属组学:对各种模型生物中金属的响应机制,它们的分子相互作用以及它们在代谢网络中的整合

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摘要

[spa] Las líneas de investigación de la presente tesis se encuentran enmarcadas en dos aspectos de la respuesta de los sistemas biológicos ante la presencia de metales. Los sujetos de investigación son tanto (1) elementos individuales (las proteínas denominadas Metalotioneínas), como (2) redes de respuesta global (Metalómica), y su relación e imbricación con el metabolismo celular (Metabolómica). Las metalotioneínas (MT), aunque ubicuas, son probablemente de origen polifilético, de modo que habrían aparecido numerosas “familias de homología” a lo largo de la evolución. El análisis computacional de los miembros de la familia de metalotioneínas en los genomas de Drosophila (5 formas parálogas), en doce especies (12 conjuntos de ortólogos) condujo a la identificación de 60 secuencias de isogenes/proteínas con secuencias de DNA/proteína altamente conservadas. La conservación en el número de isogenes del sistema MT en Drosophila sugiere que la multiplicidad de estos genes es debida a un evento evolutivo anterior a la especiación de este género. A pesar de exhibir una gran plasticidad, la región cromosómica donde se localizan los componentes del sistema de MT en Drosophila, preserva su localización en el elemento Müller E en las doce especies. La arquitectura de los genes, formados por dos exones y un intrón, también se conserva en el conjunto de ortólogos/parálogos. La reorganización identificada en la región cromosómica donde se localizan las isoformas de MT en Drosophila es debida principalmente a eventos de inversión de DNA que implican orientaciones diferentes de los cinco genes. El análisis de las propiedades de coordinación de metales de la isoforma MtnE la clasifican como una Cu-tioneína de carácter intermedio o no extremo, ya que a pesar de formar complejos homometálicos con el Cu, la capacidad de unión de cobre es menor que la observada para el resto de las isoformas. MtnE muestra la capacidad coordinante menos específica, en comparación con el resto de isoformas, lo que sugiere una función fisiológica relacionada con condiciones en las que se necesite un péptido con amplio espectro de coordinación de metales, por ejemplo condiciones de toxicidad mixta por varios metales, o elevado nivel de toxicidad de Cu en los que apoyaría la acción del resto de isoformas. Además se identificaron dos secuencias (BfMT1 y BfMT2) como potenciales MT en el genoma de Branchiostoma floridae, organismo procordado ubicado en la base evolutiva de los vertebrados. Las secuencias de ORFs, sus regiones reguladoras, y correspondientes productos proteicos, mostraron características que los reafirman como potenciales MT. Los genes BfMT1 y BfMT2 fueron identificados in vivo mediante RT-PCR sobre RNA total de organismos de Branchiostoma lanceolatum. Ambos genes se inducen in vivo en B. lanceolatum en condiciones de exceso de metales (Cd o Cu), mostrando BfMT1 un patrón correspondiente a un gen de expresión basal o constitutiva, mientras que la expresión de BfMT2 se corresponde con la de un gen inducible. El tratamiento de organismos vivos con distintas concentraciones de Cd demostró que en condiciones de exceso de este metal, se produce además una disrupción en la homoestasis del zinc. En cuanto a los elementos de respuesta global, desarrollamos el estudio genómico y transcriptómico de las redes de respuesta de S. cerevisiae como organismo modelo ante dosis excesivas de Zn que alteran sus equilibrios homeostáticos. Resultados previos de nuestro grupo mostraron una interrelación entre las vías metabólicas de respuesta a estrés de Zn y aquellas de distintos metales. Análisis de varios mutantes tolerantes a zinc nos permitió identificar una imbricación relevante entre procesos metabólicos vitales como la respiración, la respuesta a estrés oxidativo, la estabilidad del DNA mitocondrial y la tolerancia a zinc mediante redes de respuesta y señalización global que implican interconexiones de proceso
机译:[spa]本文的研究方向是从生物系统对金属存在的反应的两个方面进行的。研究对象既是(1)单个元素(称为金属硫蛋白的蛋白质),又是(2)全局应答网络(Metalomics),以及它们与细胞代谢的关系和重叠(Metabolomics)。金属硫蛋白(MT)虽然普遍存在,但可能是多系起源的,因此在整个进化过程中会出现许多“同源家族”。对果蝇基因组(5种形态学形式)中十二种(12个直系同源集)中金属硫蛋白家族成员的计算分析导致鉴定出具有高度保守的DNA /蛋白质序列的60个同基因/蛋白质序列。果蝇MT系统的同基因数目的保守性表明这些基因的多样性是由于该属物种形成前的进化事件引起的。尽管表现出很大的可塑性,但MT系统的组成部分位于果蝇中的染色体区域在所有十二个物种中都保留了其在MüllerE元素中的位置。由两个外显子和一个内含子组成的基因结构在直系同源物/旁系同源物中也被保守。在果蝇中MT同工型位于的染色体区域中识别出的重组主要是由于涉及五个基因不同方向的DNA逆转事件。对MtnE同工型的金属配位特性的分析将其归类为中间或非极端的Cu-硫氨酸,因为尽管与Cu形成了同金属络合物,但铜的结合能力却比观察到的要小。其余的亚型。与其余同工型相比,MtnE的特异性配伍能力最低,这表明其生理功能与需要具有广泛金属配位作用的肽的条件有关,例如各种金属的混合毒性条件,或高水平的铜毒性,它将支持其余同工型的作用。此外,两个序列(BfMT1和BfMT2)被确定为佛罗里达分支杆菌的基因组中潜在的MTs,该分支杆菌位于脊椎动物的进化基础上。 ORF的序列,它们的调节区和相应的蛋白质产物显示出可以再次确认它们为潜在MT的特征。 BfMT1和BfMT2基因在体内通过RT-PCR对来自轮叶分支杆菌生物的总RNA进行了鉴定。在过量金属(Cd或Cu)的条件下,两种基因均在轮叶杆菌中被体内诱导,显示BfMT1的模式与基础或组成型表达的基因相对应,而BfMT2的表达与诱导型基因的表达相对应。用不同浓度的Cd处理活生物体表明,在这种金属过量的条件下,锌均质性也受到破坏。关于整体反应的元素,我们开展了酿酒酵母反应网络的基因组和转录组学研究,作为针对过量锌改变其稳态平衡的模型生物的酿酒酵母。我们小组以前的结果表明,锌的应激反应的代谢途径与不同金属的代谢途径之间存在相互关系。对几种耐锌突变体的分析使我们能够确定重要的代谢过程之间的相关重叠,例如呼吸,对氧化应激的响应,线粒体DNA的稳定性以及通过响应网络和涉及过程互连的全局信号对锌的耐受性

著录项

  • 作者

    Guirola Tsibulova María;

  • 作者单位
  • 年度 2012
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
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  • 中图分类

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