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Metoda razvrščanja z združevanjem najbližjih sosedov v programu Orange

机译:通过在Orange程序中分组最近的邻居来进行排序的方法

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摘要

Neighbour joining builds phylogenetic trees from distance matrices. It is mainly used in bioinformatics for inference of evolutional relationships between species and prediction of common ancestors. Despite its usefulness in various applications it is rarely available in data mining programs. For this reason we implemented neighbour joining as a widget in general-purpose data mining suite Orange. We also developed several methods for visualisation of the inferred phylogenetic trees. Using our implementation on several use cases we have demonstrated that neighbour joining and constructed clustering trees are useful in data mining tasks outside the scope of bioinformatics.
机译:邻居连接从距离矩阵构建系统树。它主要用于生物信息学中,以推断物种之间的进化关系并预测共同祖先。尽管它在各种应用程序中很有用,但在数据挖掘程序中​​很少使用。因此,我们在通用数据挖掘套件Orange中将邻居加入作为小部件实现。我们还开发了几种方法来可视化推断的系统发育树。通过在几个用例上使用我们的实现,我们证明了邻居联接和构造的聚类树在生物信息学范围之外的数据挖掘任务中很有用。

著录项

  • 作者

    Šteblaj Jurij;

  • 作者单位
  • 年度 2017
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类

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