机译:CHiCP:基于Web的工具,用于启动子捕获Hi-C数据集的集成和交互式可视化
机译:Galaxy Hicexplorer 3:用于可重复的Hi-C的Web服务器,捕获Hi-C和单单元Hi-C数据分析,质量控制和可视化
机译:差异表达基因探险家(DREDGE):一种用于生成基因表达数据集的交互式在线可视化的工具
机译:基于图形的Cell类型和功能相关模块在启动子捕获Hi-C数据的特征
机译:使用层次结构探索多元数据集中的差异是一种交互式信息可视化方法。
机译:CHiCP:基于Web的工具用于启动子捕获Hi-C数据集的集成和交互式可视化
机译:图1:用于:(a)区域的长距离触点的可视化示例,这里增强了来自人胎儿脑细胞的两个10kb分辨率的Hi-C地图。从兴趣点计算联系人高达30个距离距离。顶部到底:jbrowse(Skinner等,2009)截图,具有基因和互动曲线表示(绿色兴趣点,它们的黄色接触预测); HICENTERPLISE交互配置曲线图具有强度(由距离加权)和FDR校正的P值(Q值)的-LOG10,其阈值设置为0.01。 (b)TADS,这里是来自Huvec的第17次染色体的150 KB分辨率Hi-C地图的Hicenterprise可视化。左上三角:原版Hi-C地图接触频率;右下三角形:跨度相互作用的Q值的-log10计算,使用超几何分布计算。