Hybrid Layout Algorithm using Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Space for Biochemical Network Layout

摘要

生体分子ネットワークマップを可視化するためには、生体分子ノードをレイアウトする計算方法が必要である。ネットワーク構造を詳細に理解するために、ノードのラベル領域を確保した高速なレイアウト法が望まれる。本研究では、従来の高速レイアウト法と2次元近似照合を組み合わせて、グリッド上にネットワークを配置する新規なハイブリッドレイアウトアルゴリズムを提案し、従来法との比較を行った。