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SambVca 2. A Web Tool for Analyzing Catalytic Pockets with Topographic Steric Maps

机译:SambVca 2.一种使用地形立体图分析催化口袋的网络工具

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摘要

Developing more efficient catalysts remains one of the primary targets of organometallic chemists. To accelerate reaching this goal, effective molecular descriptors and visualization tools can represent a remarkable aid. Here, we present a Web application for analyzing the catalytic pocket of metal complexes using topographic steric maps as a general and unbiased descriptor that is suitable for every class of catalysts. To show the broad applicability of our approach, we first compared the steric map of a series of transition metal complexes presenting popular mono-, di-, and tetracoordinated ligands and three classic zirconocenes. This comparative analysis highlighted similarities and differences between totally unrelated ligands. Then, we focused on a recently developed Fe(II) catalyst that is active in the asymmetric transfer hydrogenation of ketones and imines. Finally, we expand the scope of these tools to rationalize the inversion of enantioselectivity in enzymatic catalysis, achieved by point mutation of three amino acids of mononuclear p-hydroxymandelate synthase.
机译:开发更有效的催化剂仍然是有机金属化学家的主要目标之一。为了加快实现此目标,有效的分子描述符和可视化工具可以提供极大的帮助。在这里,我们介绍了一个Web应用程序,该应用程序使用地形立体图作为适用于每类催化剂的一般和无偏描述符来分析金属络合物的催化口袋。为了显示我们方法的广泛适用性,我们首先比较了一系列过渡金属配合物的空间图,这些配合物显示了流行的单配位,二配位和四配位配体以及三种经典的锆茂。这项比较分析强调了完全不相关的配体之间的异同。然后,我们集中研究了一种新开发的Fe(II)催化剂,该催化剂在酮和亚胺的不对称转移氢化中具有活性。最后,我们扩大了这些工具的范围,以合理化酶催化中对映选择性的转化,该转化是通过单核对羟基扁桃酸合酶的三个氨基酸的点突变实现的。

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