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Untersuchungen zur Differenzierung der domestizierten und der Wildform von Sus scrofa in Lebensmitteln

机译:食品中野猪的驯化和野生形式的分化研究

摘要

In dieser Arbeit wurden zahlreiche DNA-analytische Untersuchungen wie PCR-RFLP, RAPD oder Sequenzierung an Haus- und Wildschweinen vorgenommen. Durch Vergleich von Mustern und Sequenzen wurde geprüft, ob es sich um individuelle Merkmale handelt oder um gruppenspezifische Marker, die für eine Differenzierung der domestizierten Form vom Wildschwein verwendet werden können. Untersucht wurden drei Gene, die in Zusammenhang mit dem äußeren Erscheinungsbild des Tieres gebracht werden das Melanocortin-1-Rezeptor-Gen, das Tyrosinase-Gen und das Immunorezeptor DAP10-Gen. Weiterhin wurde ein Gen, zwei nicht-codierende Bereiche und Introns untersucht, die nicht mit äußeren Merkmalen in Verbindung stehen das Cytochrom B-Gen, der D-Loop-Bereich und der repetetive Bereich des Mikrosatelliten S602 sowie Introns des Immunorezeptor DAP10-Gens. Besondere Aufmerksamkeit galt dabei dem cytB-Gen, da hier bereits eine RFLP-Analytik für die Differenzierung von Haus- und Wildschweinen etabliert war, die es zu untersuchen galt. Die DNA-Sequenzvergleiche zeigten bei den untersuchten Tieren der Art Sus scrofa eine große Homogenität im Vergleich zu den Unterschieden zwischen Tieren verschiedener Arten. Bei Sequenzabweichungen handelt es sich in der Regel um isolierte Punktmutationen, die von der Art her ausschließlich Substitutionen und keine Deletionen sind. Lediglich bei der repetetiven Sequenz ist eine unterschiedliche Anzahl an Repeats und einer daraus resultierenden unterschiedlichen Länge der DNA-Sequenz vorhanden, die jedoch nicht gruppenspezifisch ist. Eine Analytik zur Differenzierung der Formen beruht somit auf der Identifizierung von Punktmutationen. Bei Untersuchung der publizierten Differenzierungsmethoden oder Sequenzheterologien von Haus- und Wildschweinen zeigte sich, dass die Muster und Sequenzen innerhalb einer Form nicht homogen sind. Es gab bei jedem Marker mehrere Individuen einer Form, deren DNA-Sequenz von der der anderen Tiere abwich. Auch bei den weiteren untersuchten Sequenzen konnten keine Mutationen gefunden werden, die bei allen Individuen einer Form identisch waren. Die Sequenzheterogenität unter allen Individuen ist größer als die zwischen der Wild- und der domestizierten Form. Für die Differenzierung der Formen ist somit die Anwendung mehrerer Marker notwendig. Die genaueste Aussage über die Identität der Probe lässt sich aufgrund der Sequenzierung mehrerer DNA-Abschnitte vornehmen. Insgesamt konnten 14 Marker, die für die Unterscheidung der Formen geeignet sind, identifiziert werden. Einige wichtige Marker lassen sich über eine PCR-RFLP-Analyse identifizieren, für zwei Marker im D-Loop wurde ein Real-Time-PCR-System entwickelt.
机译:在这项工作中,进行了许多DNA分析研究,例如PCR-RFLP,RAPD或对家养和野生猪的测序。通过比较模式和序列,检查了它们是个体特征还是群体特异性标志物,可用于区分驯养形式和野猪。研究了与动物外观相关的三个基因:黑皮质素-1受体基因,酪氨酸酶基因和免疫受体DAP10基因。此外,研究了一个基因,两个非编码区和内含子,它们与外部特征无关,细胞色素B基因,微卫星S602的D环区和重复区以及免疫受体DAP10基因的内含子。 cytB基因特别受到关注,因为已经建立了RFLP分析法来分析家猪和野猪,并需要对其进行研究。 DNA序列比较显示,与不同物种的动物之间的差异相比,Sus scrofa物种的动物具有高度的同质性。序列偏差通常是孤立的点突变,本质上仅是取代而并非缺失。仅在重复序列中存在不同数量的重复序列以及由此产生的不同长度的DNA序列,但这不是组特异性的。对形式差异的分析是基于点突变的鉴定。对已发表的家养和野生猪的分化方法或序列异质性的研究表明,某种形式内的模式和序列不均一。对于每个标记,都有几种个体,一种形式的DNA序列与其他动物的DNA序列不同。在进一步检查的序列中,没有发现在一种形式的所有个体中都相同的突变。所有个体之间的序列异质性大于野生型和驯养型之间的异质性。因此,必须使用几种标记物来区分形式。关于样品身份的最精确的陈述可以在几个DNA片段的测序基础上做出。总共鉴定出14种适合区分形式的标记。可以使用PCR-RFLP分析来识别一些重要的标记,并且为D-Loop中的两个标记开发了实时PCR系统。

著录项

  • 作者

    Butschke Andreas M. O.;

  • 作者单位
  • 年度 2004
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 German
  • 中图分类

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