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On the Estimation of the Molecular Inaccessible Volume and the Molecular Accessible Surface of a Ligand in Protein Ligand Systems

机译：关于蛋白质配体体系中配体的分子可接近体积和分子可进样表面的估计

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Konstantinos Konstantinidis; Ioannis Karakasiliοtis; Kostas Anagnostopoulos; Georgios Boulougouris;
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年度 2021
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1. Statistical Estimation of the Protein-Ligand Binding Free Energy Based On Direct Protein-Ligand Interaction Obtained by Molecular Dynamics Simulation [J] . Haruki Nakamura, Yoshifumi Fukunishi Pharmaceuticals . 2012,第10期

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2. A simple method to calculate the accessible volume of protein-bound ligands: Application for ligand selectivity [J] . Hodneland E, Teigen K Journal of molecular graphics & modelling . 2007,第2期

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3. Comparison of molecular mechanics-Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) and molecular mechanics-three-dimensional reference interaction site model (MM-3D-RISM) method to calculate the binding free energy of protein-ligand complexes: Effect of metal ion and advance statistical test [J] . Pandey Preeti, Srivastava Rakesh, Bandyopadhyay Pradipta Chemical Physics Letters . 2018,第期

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6. Statistical Estimation of the Protein-Ligand Binding Free Energy Based On Direct Protein-Ligand Interaction Obtained by Molecular Dynamics Simulation [O] . Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura 2012

机译：基于分子动力学模拟获得的直接蛋白质-配体相互作用的蛋白质-配体结合自由能的统计估计
7. Enlighten2: molecular dynamics simulations of protein–ligand systems made accessible [O] . Kirill Zinovjev, Marc W van der Kamp 2020

机译：Enlighten2：可访问的蛋白质配体系统的分子动力学模拟

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