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【2h】

Nontargeted Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Using Time-Localized Prediction of Conformational Transitions in Protein Dynamics

机译：使用蛋白质动力学中的构象过渡的时间局部化预测，不设定的并联级联选择分子动力学

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1. Nontargeted Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Using Time-Localized Prediction of Conformational Transitions in Protein Dynamics [J] . Harada Ryuhei, Sladek Vladimir, Shigeta Yasuteru Journal of chemical theory and computation: JCTC . 2019,第9期

机译：使用蛋白质动态中的综合转变的时间局限性预测，不设平行的级联选择分子动力学
2. Nontargeted Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics for Enhancing the Conformational Sampling of Proteins [J] . Harada Ryuhei, Kitao Akio Journal of chemical theory and computation: JCTC . 2015,第11期

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3. On-the-Fly Specifications of Reaction Coordinates in Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Accelerate Conformational Transitions of Proteins [J] . Harada Ryuhei, Shigeta Asuteru Journal of chemical theory and computation: JCTC . 2018,第6期

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4. Conformational Transition Pathway and Free Energy Analyses of Proteins by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD) [C] . Ryuhei Harada, Yasutaka Nishihara, Nobuhiko Wakai, International conference on computational methods in science and engineering 2014 . 2014

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5. Protein structure prediction and conformational transitions. I. Improvement of protein secondary structure prediction. II. Pathways of conformational transition originating in phosphorylation: A study of CDK2 using targeted molecular dynamics and coarse grained models [D] . Cheng, Haitao 2009

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7. Nontargeted Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Based on a Nonredundant Selection Rule for Initial Structures Enhances Conformational Sampling of Proteins [O] . -1

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