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【2h】

PWMScan: a fast tool for scanning entire genomes with a position-specific weight matrix

机译：PWMSCAN：一种快速工具，用于扫描具有特定位置的重量矩阵的整个基因组

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Giovanna Ambrosini; Romain Groux; Philipp Bucher;
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年度 2018
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1. 一种适用于具有弱环网和PV节点的配电网的增广雅可比矩阵潮流法 [J] . 陈星莺, 余昆, 单渊达东南大学学报（英文版） . 2002,第003期
2. 一种适用于具有弱环网和PV节点的配电网的增广雅可比矩阵潮流法(英文) [J] . 陈星莺, 余昆, 单渊达东南大学学报：英文版 . 2002,第003期
3. PWMScan: a fast tool for scanning entire genomes with a position-specific weight matrix [J] . Ambrosini Giovanna, Groux Romain, Bucher Philipp Bioinformatics . 2018,第14期

机译：PWMSCAN：一种快速工具，用于扫描具有特定位置的重量矩阵的整个基因组
4. protein, the Cra recognition weight matrix from foot-printing data was developed and used to scan the whole genome. Several new Cra-binding sites were found, and some of the result was consistent with the DNA microarray data. The ED pathway was active in the cra mutant; we constructed cra.edd double genes knockout mutant to block this pathway, where the acetate overflowed due to the down-regulation of aceA,B and icd gene expressions. Then we further constructed cra.edd.iclR triple genes knockout [J] . Acta Anaesthesiologica Scandinavica . 2009,第10期

机译：从脚印数据中提取出Cra识别权重矩阵，并将其用于扫描整个基因组。发现了几个新的Cra结合位点，其中一些结果与DNA微阵列数据一致。 ED途径在cra突变体中很活跃。我们构建了craded双基因敲除突变体，以阻断该途径，其中乙酸由于aceA，B和icd基因表达的下调而溢出。然后我们进一步构建了cra.edd.iclR三基因敲除
5. A fast modified protocol for random-access ultra-high density whole-genome scan: a tool for personalized genomic medicine, positional mapping, and cytogenetic analysis. [J] . Lau KC, Mak CM, Leung KY Clinica chimica acta: International journal of clinical chemistry and applied molecular biology . 2009,第1a2期

机译：用于随机访问超高密度全基因组扫描的快速修改方案：用于个性化基因组医学，位置定位和细胞遗传学分析的工具。
6. Codon Effect on the Entire Genome Based upon Genome-Wide Recoded Escherichia coli [C] . Yi Huang IEEE International Conference on Bioinformatics and Computational Biology . 2021

机译：基于基因组重新编码的大肠杆菌的整个基因组对整个基因组的密码子作用
7. DynoPoSSuM: Prediction of MHC class I-restricted epitopes coupling a dynamic database with a position-specific scoring matrix and its application. [D] . Lin, Kai-Wei. 2008

机译：DynoPoSSuM：预测MHC I类限制的抗原决定簇，结合动态数据库与位置特定的评分矩阵及其应用。
8. PWMScan: a fast tool for scanning entire genomes with a position-specific weight matrix [O] . Giovanna Ambrosini, Romain Groux, Philipp Bucher -1

机译：PWMScan：使用位置特定的权重矩阵扫描整个基因组的快速工具
9. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. [O] . Thompson, J D, Higgins, D G, Gibson, T J 1994

机译：CLUSTAL W：通过序列加权，特定位置的空位罚分和权重矩阵选择，提高逐步进行多序列比对的灵敏度。

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