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【2h】

Generalized correlation-based dynamical network analysis: a new high-performance approach for identifying allosteric communications in molecular dynamics trajectories

机译：基于相关的相关性动态网络分析：一种新的高性能方法，用于识别分子动力学轨迹中的变构通信

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Marcelo C. R. Melo; Rafael C. Bernardi; Cesar de la Fuente-Nunez; Zaida Luthey-Schulten;
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年度 2020
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1. A combined molecular dynamics and rapid kinetics approach to identify conserved three-dimensional communication networks in elongation factor Tu. [J] . Wieden HJ, Mercier E, Gray J, Biophysical Journal . 2010,第11期

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2. A study on allosteric communication in U1A-snRNA binding interactions: network analysis combined with molecular dynamics data [J] . Shao Qi, Gong Weikang, Li Chunhua Biophysical Chemistry: An International Journal Devoted to the Physical Chemistry of Biological Phenomena . 2020,第1期

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3. Molecular Dynamics Simulations and Structural Network Analysis of c-Abl and c-Src Kinase Core Proteins: Capturing Allosteric Mechanisms and Communication Pathways from Residue Centrality [J] . Tse Amanda, Verkhivker Germady M. Journal of chemical information and modeling . 2015,第8期

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4. A Generalized Multivariate Approach for Correlation-Based Pattern Discovery from Replicated Molecular Profiling Data [C] . Zhu Dongxiao, Xu Guorong, Acharya Lipi R. Bioinformatics and Biomedicine, 2009. BIBM '09 . 2009

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5. Analysis and Design of Robust and High-Performance Complex Dynamical Networks [D] . Siami, Milad. 2017

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6. A Combined Molecular Dynamics and Rapid Kinetics Approach to Identify Conserved Three-Dimensional Communication Networks in Elongation Factor Tu [O] . Hans-Joachim Wieden, Evan Mercier, John Gray, 2010

机译：结合分子动力学和快速动力学方法识别延伸因子Tu中的保守三维通信网络
7. Unraveling the Allosteric Communication Mechanisms in TCell ReceptorPeptide-Loaded Major Histocompatibility Complex Dynamics Using Molecular Dynamics Simulations: An Approach Based on Dynamic Cross Correlation Maps and Residue Interaction Energy Calculations [O] . -1

机译：利用分子动力学模拟解开TCell受体加载的主要组织相容性复杂动力学的变构通信机制：一种基于动态交叉关系图的方法和残留物交互能量计算

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