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【2h】

BiTSC2: Bayesian inference of Tumor clonal Tree by joint analysis of Single-Cell SNV and CNA data

机译：BITSC2：通过单细胞SNV和CNA数据的联合分析通过联合分析肿瘤克隆树的贝叶斯推动

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Ziwei Chen; Fuzhou Gong; Lin Wan; Liang Ma;
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年度 2020
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1. SiCloneFit: Bayesian inference of population structure, genotype, and phylogeny of tumor clones from single-cell genome sequencing data [J] . Zafar Hamim, Navin Nicholas, Chen Ken, Genome research . 2019,第11期

机译：SICLONEFIT：单细胞基因组测序数据中患有人口结构，基因型和肿瘤克隆的系统的贝叶斯结构，基因型和系统
2. Conifer: clonal tree inference for tumor heterogeneity with single-cell and bulk sequencing data [J] . Baghaarabani Leila, Goliaei Sama, Foroughmand-Araabi Mohammad-Hadi, BMC Bioinformatics . 2021,第1期

机译：针叶树：具有单细胞和散装测序数据的肿瘤异质性的克隆树推理
3. RobustClone: a robust PCA method for tumor clone and evolution inference from single-cell sequencing data [J] . Chen Ziwei, Gong Fuzhou, Wan Lin, Bioinformatics . 2020,第11期

机译：robustClone：一种用于肿瘤克隆的鲁棒PCA方法和来自单细胞测序数据的肿瘤克隆和进化推断
4. COMPARING NONPARAMETRIC BAYESIAN TREE PRIORS FOR CLONAL RECONSTRUCTION OF TUMORS [C] . AMIT G.DESHWAR, SHANKAR VEMBU, QUAID MORRIS Pacific Symposium on Biocomputing . 2015

机译：比较肿瘤克隆重建的非参数贝叶斯树前方
5. Graph-based data analysis: Tree-structured covariance estimation, prediction by regularized kernel estimation and aggregate database query processing for probabilistic inference. [D] . Bravo, Hector Corrada. 2008

机译：基于图的数据分析：树状协方差估计，通过正则核估计进行预测以及用于概率推断的聚合数据库查询处理。
6. SiCloneFit: Bayesian inference of population structure genotype and phylogeny of tumor clones from single-cell genome sequencing data [O] . Hamim Zafar, Nicholas Navin, Ken Chen, 2019

机译：SiCloneFit：根据单细胞基因组测序数据对肿瘤克隆的种群结构基因型和系统发育进行贝叶斯推断
7. SNV-PPILP: Refined SNV calling for tumor data using perfect phylogenies and ILP [O] . Karen E. Van Rens, Ru I. Tomescu 2016

机译：sNV-ppILp：精制sNV使用完美的系统发育和ILp来调用肿瘤数据

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