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【2h】

Particle Mesh Ewald for Molecular Dynamics in OpenCL on an FPGA Cluster

机译：用于FPGA簇的OpenCL中分子动力学的粒子网eWALD

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Lawrence C. Stewart; Carlo Pascoe; Emery Davis; Brian W. Sherman; Martin Herbordt; Vipin Sachdeva;
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年度 2021
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1. On the Numerical Accuracy of Ewald, Smooth Particle Mesh Ewald, and Staggered Mesh Ewald Methods for Correlated Molecular Systems [J] . Han Wang, Pingwen Zhang, Christof Schutte Journal of chemical theory and computation: JCTC . 2012,第9期

机译：相关分子系统的Ewald，光滑粒子网格Ewald和交错网格Ewald方法的数值精度
2. Molecular Dynamics Simulations on Solvated Biomolecular Systems: The Particle Mesh Ewald Method Leads to Stable Trajectories of DNA, RNA, and Proteins [J] . T. E. Cheatham III, J. L. Miller, T. Fox, Journal of the American Chemical Society . 1995,第14期

机译：溶剂化生物分子系统上的分子动力学模拟：粒子网格Ewald方法导致DNA，RNA和蛋白质的稳定轨迹
3. All-Atom Continuous Constant pH Molecular Dynamics With Particle Mesh Ewald and Titratable Water [J] . Huang Yandong, Chen Wei, Wallace Jason A., Journal of chemical theory and computation: JCTC . 2016,第11期

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4. Particle Mesh Ewald for Molecular Dynamics in OpenCL on an FPGA Cluster [C] . Lawrence C. Stewart, Carlo Pascoe, Emery Davis, IEEE Annual International Symposium on Field-Programmable Custom Computing Machines . 2021

机译：FPGA集群OpenCL中的分子动力学粒子网eWALD
5. An FPGA implementation of the smooth particle mesh Ewald Reciprocal Sum Compute Engine (RSCE). [D] . Lee, Sam. 2005

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6. NMR structure refinement and dynamics of the K+-d(G3T4G3)2 quadruplex via particle mesh Ewald molecular dynamics simulations. [O] . G D Strahan, M A Keniry, R H Shafer 1998

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7. NMR Structure Refinement and Dynamics of the K �-[d(G 3T 4G 3)] 2 Quadruplex via Particle Mesh Ewald Molecular Dynamics Simulations [O] . Gary D. Strahan, Max A. Keniry, Richard H. Shafer 2008

机译：通过粒子网格Ewald分子动力学模拟的核磁共振结构细化和K�-[d（G 3T 4G 3）] 2四链体的动力学

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