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Looking for breed differentiating SNP loci and for a SNP set for parentage testing in Mangalica

机译:寻找可区分SNP基因座的品种以及用于Mangalica的亲子鉴定的SNP集

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摘要

The whole genome of Mangalica animals has been screened on the Illumina porcine chip giving the possibility (1) to replace the previously applied ten microsatellite markers by nine SNP loci to classify the Blond, Swallow-Belly and Red Mangalica individuals into three different breed groups (>0.95); (2) to propose 54 SNP loci for parentage testing in Mangalica pigs where the exclusion probability is 0.999115 if one parent is known and the probability of identity is 1.54×10.
机译:已在Illumina猪芯片上筛选了Mangalica动物的整个基因组,从而有可能(1)用9个SNP位点取代先前应用的10个微卫星标记,从而将Blond,Swallow-Belly和Red Mangalica个体分为三个不同的品种组( > 0.95); (2)提出了54个SNP位点,用于在Mangalica猪中进行亲子鉴定,如果已知一位亲本且同一性的概率为1.54×10,则排除概率为0.999115。

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