Thermodynamics; Muscles; Models; Energy transfer; Free energy; Reprints;
机译:利用分子动力学模拟结合三维参考相互作用位点模型理论进行自由能计算。 I.沿耦合参数的自由能摄动和热力学积分
机译:肽基团的溶剂化自由能:其模型依赖性和对蛋白质稳定性的累加转移自由能模型的启示
机译:氨基酸从疏水溶液到水溶液的溶剂自由能和转移自由能,来自一个非常简单的残基模型
机译:冷冻/解冻动作引起混凝土破坏机制模型。
机译:在自由基重氮引发剂作为还原剂存在下,铜催化的原子转移自由基过程的动力学和热力学研究。
机译:肽基团的溶剂化自由能:其模型依赖性及其对蛋白质稳定性加成转移自由能模型的启示
机译:通过使用适当选择的热力学循环和热力学积分方法进行蒙特卡罗计算机模拟,研究了将五种甲酰胺模型和三种水模型混合在一起时发生的热力学变化,包括这些模型组合本身的可混溶性。结果表明这两种组分的混合接近于理想的混合,因为混合的能量和熵在整个组成范围内都非常接近理想的项。关于混合的能量,甲酰胺的OPLS / AA-mod模型与其他模型相比,在质量上有不同的表现。因此,该模型得出的结果是负的,而其他模型则综合考虑了所有三个水模型的结果的正能量。实验数据支持后一种行为。尽管混合的亥姆霍兹自由能在整个组成范围内始终为负,但大多数测试模型组合显示出有限的混溶性,或至少非常接近某些组合物的混溶性极限。关于这些模型组合的可混溶性和混合能量,我们建议在水-甲酰胺混合物的模拟中使用CHARMM甲酰胺和TIP4P水模型的组合。