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Database: The Journal of Biological Databases and Curation

【机译】：数据库：期刊生物数据库和策展

ISSN：-
出版周期：
语言：English

起始发布年份：2009
出版者：Oxford : Oxford Journals, 2009-
出版地：England

数据库引入：PubMed: 2009-, PMC

MeSH词表主题词：Computational Biology*

备注：Title from journal home page (viewed May 1, 2009). Latest issue consulted: Vol.展开▼

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1.Determining similarity of scientific entities in annotation datasets

机译：确定注释数据集中科学实体的相似性
- 作者：Guillermo Palma;Maria-Esther Vidal;Eric Haag;Louiqa Raschid;Andreas Thor
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
2.PreDREM: a database of predicted DNA regulatory motifs from 349 human cell and tissue samples

机译：PreDREM：从349个人类细胞和组织样品中预测的DNA调控基序的数据库
- 作者：Yiyu Zheng;Xiaoman Li;Haiyan Hu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
3.MnTEdb a collective resource for mulberry transposable elements

机译：MnTEdb桑蚕转座因子的集体资源
- 作者：Bi Ma;Tian Li;Zhonghuai Xiang;Ningjia He
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
4.Merging and scoring molecular interactions utilising existing community standards: tools use-cases and a case study

机译：利用现有社区标准合并和评分分子相互作用：工具用例和案例研究
- 作者：J. M. Villaveces;R. C. Jiménez;P. Porras;N. del-Toro;M. Duesbury;M. Dumousseau;S. Orchard;H. Choi;P. Ping;N. C. Zong;M. Askenazi;B. H. Habermann;Henning Hermjakob
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
5.EcoliNet: a database of cofunctional gene network for Escherichia coli

机译：EcoliNet：大肠杆菌共功能基因网络数据库
- 作者：Hanhae Kim;Jung Eun Shim;Junha Shin;Insuk Lee
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
6.Modeling a microbial community and biodiversity assay with OBO Foundry ontologies: the interoperability gains of a modular approach

机译：使用OBO Foundry本体建模微生物群落和生物多样性分析：模块化方法的互操作性收益
- 作者：Philippe Rocca-Serra;Ramona Walls;Jacob Parnell;Rachel Gallery;Jie Zheng;Susanna-Assunta Sansone;Alejandra Gonzalez-Beltran
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
7.Fishing for data and sorting the catch: assessing the data quality completeness and fitness for use of data in marine biogeographic databases

机译：捕捞数据并对渔获物进行分类：评估数据质量完整性和适合在海洋生物地理数据库中使用的数据
- 作者：Leen Vandepitte;Samuel Bosch;Lennert Tyberghein;Filip Waumans;Bart Vanhoorne;Francisco Hernandez;Olivier De Clerck;Jan Mees
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
8.Comparison of human cell signaling pathway databases—evolution drawbacks and challenges

机译：人类细胞信号通路数据库的比较-演变缺点和挑战
- 作者：Saikat Chowdhury;Ram Rup Sarkar
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
9.CyanOmics: an integrated database of omics for the model cyanobacterium Synechococcus sp. PCC 7002

机译：CyanOmics：模型蓝藻Synechococcus sp。的组学综合数据库。 PCC 7002
- 作者：Yaohua Yang;Jie Feng;Tao Li;Feng Ge;Jindong Zhao
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
10.PhenoMiner: a quantitative phenotype database for the laboratory rat Rattus norvegicus. Application in hypertension and renal disease

机译：PhenoMiner：实验室老鼠Rattus norvegicus的定量表型数据库。在高血压和肾脏疾病中的应用
- 作者：Shur-Jen Wang;Stanley J. F. Laulederkind;G. Thomas Hayman;Victoria Petri;Weisong Liu;Jennifer R. Smith;Rajni Nigam;Melinda R. Dwinell;Mary Shimoyama
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2015年第-1期
11.DCDB 2.0: a major update of the drug combination database

机译：DCDB 2.0：药物组合数据库的重大更新
- 作者：Yanbin Liu;Qiang Wei;Guisheng Yu;Wanxia Gai;Yongquan Li;Xin Chen
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
12.EssOilDB: a database of essential oils reflecting terpene composition and variability in the plant kingdom

机译：EssOilDB：反映植物界中萜烯成分和变异性的精油数据库
- 作者：Sangita Kumari;Sachin Pundhir;Piyush Priya;Ganga Jeena;Ankita Punetha;Konika Chawla;Zohra Firdos Jafaree;Subhasish Mondal;Gitanjali Yadav
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
13.dbPPT: a comprehensive database of protein phosphorylation in plants

机译：dbPPT：植物蛋白质磷酸化的综合数据库
- 作者：Han Cheng;Wankun Deng;Yongbo Wang;Jian Ren;Zexian Liu;Yu Xue
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
14.HGVTB: a comprehensive online resource on human genes and genetic variants associated with tuberculosis

机译：HGV＆TB：有关结核病的人类基因和遗传变异的综合在线资源
- 作者：Ruchika Sahajpal;Gaurav Kandoi;Heena Dhiman;Sweety Raj;Vinod Scaria;Deeksha Bhartiya;Yasha Hasija
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
15.AIM: a comprehensive Arabidopsis interactome module database and related interologs in plants

机译：目标：植物中一个完整的拟南芥相互作用组模块数据库和相关的内向同源物
- 作者：Yi Wang;Roger Thilmony;Yunjun Zhao;Guoping Chen;Yong Q. Gu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
16.BactPepDB: a database of predicted peptides from a exhaustive survey of complete prokaryote genomes

机译：BactPepDB：从完整的原核生物基因组详尽调查中获得的预测肽数据库
- 作者：Julien Rey;Patrick Deschavanne;Pierre Tuffery
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
17.CBMAR: a comprehensive β-lactamase molecular annotation resource

机译：CBMAR：全面的β-内酰胺酶分子注释资源
- 作者：Abhishikha Srivastava;Neelja Singhal;Manisha Goel;Jugsharan Singh Virdi;Manish Kumar
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
18.The Halophile Protein Database

机译：嗜盐蛋白质数据库
- 作者：Naveen Sharma;Mohammad Samir Farooqi;Krishna Kumar Chaturvedi;Shashi Bhushan Lal;Monendra Grover;Anil Rai;Pankaj Pandey
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
19.AromaDeg a novel database for phylogenomics of aerobic bacterial degradation of aromatics

机译：AromaDeg用于芳香族化合物好氧细菌降解的系统进化组学的新型数据库
- 作者：Márcia Duarte;Ruy Jauregui;Ramiro Vilchez-Vargas;Howard Junca;Dietmar H. Pieper
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
20.A robust data-driven approach for gene ontology annotation

机译：一种可靠的数据驱动的基因本体注释方法
- 作者：Yanpeng Li;Hong Yu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
21.Small molecule annotation for the Protein Data Bank

机译：蛋白质数据库的小分子注释
- 作者：Sanchayita Sen;Jasmine Young;John M. Berrisford;Minyu Chen;Matthew J. Conroy;Shuchismita Dutta;Luigi Di Costanzo;Guanghua Gao;Sutapa Ghosh;Brian P. Hudson;Reiko Igarashi;Yumiko Kengaku;Yuhe Liang;Ezra Peisach;Irina Persikova;Abhik Mukhopadhyay;Buvaneswari Coimbatore Narayanan;Gaurav Sahni;Junko Sato;Monica Sekharan;Chenghua Shao;Lihua Tan;Marina A. Zhuravleva
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
22.microPIR2: a comprehensive database for human–mouse comparative study of microRNA–promoter interactions

机译：microPIR2：用于人与小鼠的microRNA-启动子相互作用比较研究的综合数据库
- 作者：Jittima Piriyapongsa;Chaiwat Bootchai;Chumpol Ngamphiw;Sissades Tongsima
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
23.piRBase: a web resource assisting piRNA functional study

机译：piRBase：辅助piRNA功能研究的网络资源
- 作者：Peng Zhang;Xiaohui Si;Geir Skogerbø;Jiajia Wang;Dongya Cui;Yongxing Li;Xubin Sun;Li Liu;Baofa Sun;Runsheng Chen;Shunmin He;Da-Wei Huang
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
24.Kin-Driver: a database of driver mutations in protein kinases

机译：Kin-Driver：蛋白激酶中驱动程序突变的数据库
- 作者：Franco L. Simonetti;Cristian Tornador;Nuria Nabau-Moretó;Miguel A. Molina-Vila;Cristina Marino-Buslje
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
25.Knowledge-rich temporal relation identification and classification in clinical notes

机译：临床笔记中知识丰富的时间关系识别和分类
- 作者：Jennifer D’Souza;Vincent Ng
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
26.iPathCons and iPathDB: an improved insect pathway construction tool and the database

机译：iPathCons和iPathDB：改进的昆虫通道构建工具和数据库
- 作者：Zan Zhang;Chuanlin Yin;Ying Liu;Wencai Jie;Wenjie Lei;Fei Li
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
27.VIRmiRNA: a comprehensive resource for experimentally validated viral miRNAs and their targets

机译：VIRmiRNA：用于实验验证的病毒miRNA及其靶标的综合资源
- 作者：Abid Qureshi;Nishant Thakur;Isha Monga;Anamika Thakur;Manoj Kumar
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
28.A Web-based database of genetic association studies in cutaneous melanoma enhanced with network-driven data exploration tools

机译：基于网络的数据探索工具增强了基于Web的皮肤黑色素瘤遗传关联研究数据库
- 作者：Emmanouil I. Athanasiadis;Kyriaki Antonopoulou;Foteini Chatzinasiou;Christina M. Lill;Marilena M. Bourdakou;Argiris Sakellariou;Katerina Kypreou;Irene Stefanaki;Evangelos Evangelou;John P.A. Ioannidis;Lars Bertram;Alexander J. Stratigos;George M. Spyrou
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
29.ChloroSSRdb: a repository of perfect and imperfect chloroplastic simple sequence repeats (cpSSRs) of green plants

机译：ChloroSSRdb：完美和不完美的绿色植物的叶绿素简单序列重复序列（cpSSR）的存储库
- 作者：Aditi Kapil;Piyush Kant Rai;Asheesh Shanker
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
30.The Virtual Xenbase: transitioning an online bioinformatics resource to a private cloud

机译：虚拟Xenbase：将在线生物信息学资源过渡到私有云
- 作者：Kamran Karimi;Peter D. Vize
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
31.PolyprOnline: polyproline helix II and secondary structure assignment database

机译：PolyprOnline：polyproline helix II和二级结构分配数据库
- 作者：Romain Chebrek;Sylvain Leonard;Alexandre G. de Brevern;Jean-Christophe Gelly
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
32.BactPepDB: a database of predicted peptides from a exhaustive survey of complete prokaryote genomes

机译：BactPepDB：从完整的原核生物基因组详尽调查中获得的预测肽数据库
- 作者：Julien Rey;Patrick Deschavanne;Pierre Tuffery
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
33.DEOP: a database on osmoprotectants and associated pathways

机译：DROP：渗透防护剂和相关途径的数据库
- 作者：Salim Bougouffa;Aleksandar Radovanovic;Magbubah Essack;Vladimir B. Bajic
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
34.MetaProx: the database of metagenomic proximons

机译：MetaProx：宏基因组proximons数据库
- 作者：Gregory Vey;Trevor C. Charles
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
35.miRIAD—integrating microRNA inter- and intragenic data

机译：miRIAD-整合microRNA基因间和基因内部数据
- 作者：Ludwig Christian Hinske;Gustavo S. França;Hugo A. M. Torres;Daniel T. Ohara;Camila M. Lopes-Ramos;Jens Heyn;Luiz F. L. Reis;Lucila Ohno-Machado;Simone Kreth;Pedro A. F. Galante
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
36.CanvasDB: a local database infrastructure for analysis of targeted- and whole genome re-sequencing projects

机译：CanvasDB：用于分析目标基因组和整个基因组重测序项目的本地数据库基础结构
- 作者：Adam Ameur;Ignas Bunikis;Stefan Enroth;Ulf Gyllensten
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
37.The Cancer Genomics Hub (CGHub): overcoming cancer through the power of torrential data

机译：癌症基因组学中心（CGHub）：通过洪流数据的力量克服癌症
- 作者：Christopher Wilks;Melissa S. Cline;Erich Weiler;Mark Diehkans;Brian Craft;Christy Martin;Daniel Murphy;Howdy Pierce;John Black;Donavan Nelson;Brian Litzinger;Thomas Hatton;Lori Maltbie;Michael Ainsworth;Patrick Allen;Linda Rosewood;Elizabeth Mitchell;Bradley Smith;Jim Warner;John Groboske;Haifang Telc;Daniel Wilson;Brian Sanford;Hannes Schmidt;David Haussler;Daniel Maltbie
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
38.CarrotDB: a genomic and transcriptomic database for carrot

机译：CarrotDB：胡萝卜的基因组和转录组数据库
- 作者：Zhi-Sheng Xu;Hua-Wei Tan;Feng Wang;Xi-Lin Hou;Ai-Sheng Xiong
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
39.An online system for metabolic network analysis

机译：在线代谢网络分析系统
- 作者：Abdullah Ercument Cicek;Xinjian Qi;Ali Cakmak;Stephen R. Johnson;Xu Han;Sami Alshalwi;Zehra Meral Ozsoyoglu;Gultekin Ozsoyoglu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
40.Renal Gene Expression Database (RGED): a relational database of gene expression profiles in kidney disease

机译：肾脏基因表达数据库（RGED）：肾脏疾病中基因表达谱的关系数据库
- 作者：Qingzhou Zhang;Bo Yang;Xujiao Chen;Jing Xu;Changlin Mei;Zhiguo Mao
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
41.Hybrid curation of gene–mutation relations combining automated extraction and crowdsourcing

机译：结合自动提取和众包的基因突变关系的混合管理
- 作者：John D. Burger;Emily Doughty;Ritu Khare;Chih-Hsuan Wei;Rajashree Mishra;John Aberdeen;David Tresner-Kirsch;Ben Wellner;Maricel G. Kann;Zhiyong Lu;Lynette Hirschman
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
42.WholeCellSimDB: a hybrid relational/HDF database for whole-cell model predictions

机译：WholeCellSimDB：用于全细胞模型预测的混合关系/ HDF数据库
- 作者：Jonathan R. Karr;Nolan C. Phillips;Markus W. Covert
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
43.RADB: a database of rheumatoid arthritis-related polymorphisms

机译：RADB：类风湿关节炎相关多态性数据库
- 作者：Ruijie Zhang;Meiwei Luan;Zhenwei Shang;Lian Duan;Guoping Tang;Miao Shi;Wenhua Lv;Hongjie Zhu;Jin Li;Hongchao Lv;Mingming Zhang;Guiyou Liu;He Chen;Yongshuai Jiang
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
44.Unsupervised gene function extraction using semantic vectors

机译：使用语义向量的无监督基因功能提取
- 作者：Ehsan Emadzadeh;Azadeh Nikfarjam;Rachel E. Ginn;Graciela Gonzalez
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
45.A semi-automated methodology for finding lipid-related GO terms

机译：半自动方法用于查找与脂质相关的GO术语
- 作者：Mengyuan Fan;Hong Sang Low;Markus R. Wenk;Limsoon Wong
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
46.‘Isotopo’ a database application for facile analysis and management of mass isotopomer data

机译：Isotopo数据库应用程序可轻松分析和管理质量同位素异构体数据
- 作者：Zeeshan Ahmed;Saman Zeeshan;Claudia Huber;Michael Hensel;Dietmar Schomburg;Richard Münch;Eva Eylert;Wolfgang Eisenreich;Thomas Dandekar
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
47.Closing the loop: from paper to protein annotation using supervised Gene Ontology classification

机译：闭环：使用监督的基因本体分类从论文到蛋白质注释
- 作者：Julien Gobeill;Emilie Pasche;Dina Vishnyakova;Patrick Ruch
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
48.Integrating information retrieval with distant supervision for Gene Ontology annotation

机译：将信息检索与远程监督相集成以进行基因本体注释
- 作者：Dongqing Zhu;Dingcheng Li;Ben Carterette;Hongfang Liu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
49.LiverCancerMarkerRIF: a liver cancer biomarker interactive curation system combining text mining and expert annotations

机译：LiverCancerMarkerRIF：结合文本挖掘和专家注释的肝癌生物标志物交互式管理系统
- 作者：Hong-Jie Dai;Johnny Chi-Yang Wu;Wei-San Lin;Aaron James F. Reyes;Mira Anne C. dela Rosa;Shabbir Syed-Abdul;Richard Tzong-Han Tsai;Wen-Lian Hsu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
50.Overview of the gene ontology task at BioCreative IV

机译：BioCreative IV的基因本体任务概述
- 作者：Yuqing Mao;Kimberly Van Auken;Donghui Li;Cecilia N. Arighi;Peter McQuilton;G. Thomas Hayman;Susan Tweedie;Mary L. Schaeffer;Stanley J. F. Laulederkind;Shur-Jen Wang;Julien Gobeill;Patrick Ruch;Anh Tuan Luu;Jung-jae Kim;Jung-Hsien Chiang;Yu-De Chen;Chia-Jung Yang;Hongfang Liu;Dongqing Zhu;Yanpeng Li;Hong Yu;Ehsan Emadzadeh;Graciela Gonzalez;Jian-Ming Chen;Hong-Jie Dai;Zhiyong Lu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
51.miRBase Tracker: keeping track of microRNA annotation changes

机译：miRBase Tracker：跟踪microRNA注释变化
- 作者：Gert Van Peer;Steve Lefever;Jasper Anckaert;Anneleen Beckers;Ali Rihani;Alan Van Goethem;Pieter-Jan Volders;Fjoralba Zeka;Maté Ongenaert;Pieter Mestdagh;Jo Vandesompele
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
52.FusoBase: an online Fusobacterium comparative genomic analysis platform

机译：FusoBase：在线镰刀菌比较基因组分析平台
- 作者：Mia Yang Ang;Hamed Heydari;Nick S. Jakubovics;Mahafizul Imran Mahmud;Avirup Dutta;Wei Yee Wee;Guat Jah Wong;Naresh V.R. Mutha;Shi Yang Tan;Siew Woh Choo
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
53.Mouse IDGenes: a reference database for genetic interactions in the developing mouse brain

机译：小鼠IDGenes：发育中的小鼠大脑中遗传相互作用的参考数据库
- 作者：Michaela Matthes;Martin Preusse;Jingzhong Zhang;Julia Schechter;Daniela Mayer;Bernd Lentes;Fabian Theis;Nilima Prakash;Wolfgang Wurst;Dietrich Trümbach
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
54.PlantCAZyme: a database for plant carbohydrate-active enzymes

机译：PlantCAZyme：植物碳水化合物活性酶的数据库
- 作者：Alexander Ekstrom;Rahil Taujale;Nathan McGinn;Yanbin Yin
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
55.LeishMicrosatDB: open source database of repeat sequences detected in six fully sequenced Leishmania genomes

机译：LeishMicrosatDB：在六个完全测序的利什曼原虫基因组中检测到的重复序列的开源数据库
- 作者：Manas R. Dikhit;Kanhu C. Moharana;Bikash R. Sahoo;Ganesh C. Sahoo;Pradeep Das
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
56.RLIMS-P: an online text-mining tool for literature-based extraction of protein phosphorylation information

机译：RLIMS-P：一种在线文本挖掘工具用于基于文献的蛋白质磷酸化信息提取
- 作者：Manabu Torii;Gang Li;Zhiwen Li;Rose Oughtred;Francesca Diella;Irem Çelen;Cecilia N. Arighi;Hongzhan Huang;K. Vijay-Shanker;Cathy H. Wu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
57.BC4GO: a full-text corpus for the BioCreative IV GO task

机译：BC4GO：BioCreative IV GO任务的全文语料库
- 作者：Kimberly Van Auken;Mary L. Schaeffer;Peter McQuilton;Stanley J. F. Laulederkind;Donghui Li;Shur-Jen Wang;G. Thomas Hayman;Susan Tweedie;Cecilia N. Arighi;James Done;Hans-Michael Müller;Paul W. Sternberg;Yuqing Mao;Chih-Hsuan Wei;Zhiyong Lu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
58.tmBioC: improving interoperability of text-mining tools with BioC

机译：tmBioC：提高文本挖掘工具与BioC的互操作性
- 作者：Ritu Khare;Chih-Hsuan Wei;Yuqing Mao;Robert Leaman;Zhiyong Lu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
59.APADB: a database for alternative polyadenylation and microRNA regulation events

机译：APADB：替代性聚腺苷酸化和microRNA调控事件的数据库
- 作者：Sören Müller;Lukas Rycak;Fabian Afonso-Grunz;Peter Winter;Adam M. Zawada;Ewa Damrath;Jessica Scheider;Juliane Schmäh;Ina Koch;Günter Kahl;Björn Rotter
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
60.Standardized description of scientific evidence using the Evidence Ontology (ECO)

机译：使用证据本体论（ECO）对科学证据进行标准化描述
- 作者：Marcus C. Chibucos;Christopher J. Mungall;Rama Balakrishnan;Karen R. Christie;Rachael P. Huntley;Owen White;Judith A. Blake;Suzanna E. Lewis;Michelle Giglio
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
61.Assisting manual literature curation for protein–protein interactions using BioQRator

机译：使用BioQRator协助手工文献管理蛋白质间相互作用
- 作者：Dongseop Kwon;Sun Kim;Soo-Yong Shin;Andrew Chatr-aryamontri;W. John Wilbur
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
62.Text-mining-assisted biocuration workflows in Argo

机译：Argo中的文本挖掘辅助生物固化工作流程
- 作者：Rafal Rak;Riza Theresa Batista-Navarro;Andrew Rowley;Jacob Carter;Sophia Ananiadou
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
63.RTeQTL: Real-Time Online Engine for Expression Quantitative Trait Loci Analyses

机译：RTeQTL：用于表达定量性状位点分析的实时在线引擎
- 作者：Baoshan Ma;Jinyan Huang;Liming Liang
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
64.Erratum

机译：勘误表
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
65.OMICtools: an informative directory for multi-omic data analysis

机译：OMICtools：用于进行多组数据分析的信息性目录
- 作者：Vincent J. Henry;Anita E. Bandrowski;Anne-Sophie Pepin;Bruno J. Gonzalez;Arnaud Desfeux
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
66.yStreX: yeast stress expression database

机译：yStreX：酵母应激表达数据库
- 作者：Kwanjeera Wanichthanarak;Intawat Nookaew;Dina Petranovic
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
67.‘RetinoGenetics’: a comprehensive mutation database for genes related to inherited retinal degeneration

机译：RetinoGenetics：一个综合的突变数据库用于与遗传性视网膜变性相关的基因
- 作者：Xia Ran;Wei-Jun Cai;Xiu-Feng Huang;Qi Liu;Fan Lu;Jia Qu;Jinyu Wu;Zi-Bing Jin
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
68.Processing biological literature with customizable Web services supporting interoperable formats

机译：使用支持互操作格式的可定制Web服务处理生物学文献
- 作者：Rafal Rak;Riza Theresa Batista-Navarro;Jacob Carter;Andrew Rowley;Sophia Ananiadou
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
69.ChiloDB: a genomic and transcriptome database for an important rice insect pest Chilo suppressalis

机译：ChiloDB：重要水稻害虫Chilohibialis的基因组和转录组数据库
- 作者：Chuanlin Yin;Ying Liu;Jinding Liu;Huamei Xiao;Shuiqing Huang;Yongjun Lin;Zhaojun Han;Fei Li
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
70.Finding needles in haystacks: linking scientific names reference specimens and molecular data for Fungi

机译：在干草堆中寻找针头：链接真菌的科学名称参考样本和分子数据
- 作者：Conrad L. Schoch;Barbara Robbertse;Vincent Robert;Duong Vu;Gianluigi Cardinali;Laszlo Irinyi;Wieland Meyer;R. Henrik Nilsson;Karen Hughes;Andrew N. Miller;Paul M. Kirk;Kessy Abarenkov;M. Catherine Aime;Hiran A. Ariyawansa;Martin Bidartondo;Teun Boekhout;Bart Buyck;Qing Cai;Jie Chen;Ana Crespo;Pedro W. Crous;Ulrike Damm;Z. Wilhelm De Beer;Bryn T. M. Dentinger;Pradeep K. Divakar;Margarita Dueñas;Nicolas Feau;Katerina Fliegerova;Miguel A. García;Zai-Wei Ge;Gareth W. Griffith;Johannes Z. Groenewald;Marizeth Groenewald;Martin Grube;Marieka Gryzenhout;Cécile Gueidan;Liangdong Guo;Sarah Hambleton;Richard Hamelin;Karen Hansen;Valérie Hofstetter;Seung-Beom Hong;Jos Houbraken;Kevin D. Hyde;Patrik Inderbitzin;Peter R. Johnston;Samantha C. Karunarathna;Urmas Kõljalg;Gábor M. Kovács;Ekaphan Kraichak;Krisztina Krizsan;Cletus P. Kurtzman;Karl-Henrik Larsson;Steven Leavitt;Peter M. Letcher;Kare Liimatainen;Jian-Kui Liu;D. Jean Lodge;Janet Jennifer Luangsa-ard;H. Thorsten Lumbsch;Sajeewa S.N. Maharachchikumbura;Dimuthu Manamgoda;María P. Martín;Andrew M. Minnis;Jean-Marc Moncalvo;Giuseppina Mulè;Karen K. Nakasone;Tuula Niskanen;Ibai Olariaga;Tamás Papp;Tamás Petkovits;Raquel Pino-Bodas;Martha J. Powell;Huzefa A. Raja;Dirk Redecker;J. M. Sarmiento-Ramirez;Keith A. Seifert;Bhushan Shrestha;Soili Stenroos;Benjamin Stielow;Sung-Oui Suh;Kazuaki Tanaka;Leho Tedersoo;M. Teresa Telleria;Dhanushka Udayanga;Wendy A. Untereiner;Javier Diéguez Uribeondo;Krishna V. Subbarao;Csaba Vágvölgyi;Cobus Visagie;Kerstin Voigt;Donald M. Walker;Bevan S. Weir;Michael Weiß;Nalin N. Wijayawardene;Michael J. Wingfield;J. P. Xu;Zhu L. Yang;Ning Zhang;Wen-Ying Zhuang;Scott Federhen
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
71.Plant rDNA database: update and new features

机译：Plant rDNA数据库：更新和新功能
- 作者：Sònia Garcia;Francisco Gálvez;Airy Gras;Aleš Kovařík;Teresa Garnatje
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
72.BioC interoperability track overview

机译：BioC互操作性跟踪概述
- 作者：Donald C. Comeau;Riza Theresa Batista-Navarro;Hong-Jie Dai;Rezarta Islamaj Doğan;Antonio Jimeno Yepes;Ritu Khare;Zhiyong Lu;Hernani Marques;Carolyn J. Mattingly;Mariana Neves;Yifan Peng;Rafal Rak;Fabio Rinaldi;Richard Tzong-Han Tsai;Karin Verspoor;Thomas C. Wiegers;Cathy H. Wu;W. John Wilbur
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
73.BioC implementations in Go Perl Python and Ruby

机译：GoPerlPython和Ruby中的BioC实现
- 作者：Wanli Liu;Rezarta Islamaj Doğan;Dongseop Kwon;Hernani Marques;Fabio Rinaldi;W. John Wilbur;Donald C. Comeau
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
74.A controlled vocabulary for pathway entities and events

机译：路径实体和事件的受控词汇表
- 作者：Steve Jupe;Bijay Jassal;Mark Williams;Guanming Wu
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
75.UCbase 2.0: ultraconserved sequences database (2014 update)

机译：UCbase 2.0：超保守序列数据库（2014更新）
- 作者：Vincenzo Lomonaco;Riccardo Martoglia;Federica Mandreoli;Laura Anderlucci;Warren Emmett;Silvio Bicciato;Cristian Taccioli
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
76.A novel multi-alignment pipeline for high-throughput sequencing data

机译：用于高通量测序数据的新型多比对管线
- 作者：Shunping Huang;James Holt;Chia-Yu Kao;Leonard McMillan;Wei Wang
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
77.‘RetinoGenetics’: a comprehensive mutation database for genes related to inherited retinal degeneration

机译：RetinoGenetics：一个综合的突变数据库用于与遗传性视网膜变性相关的基因
- 作者：Xia Ran;Wei-Jun Cai;Xiu-Feng Huang;Qi Liu;Fan Lu;Jia Qu;Jinyu Wu;Zi-Bing Jin
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
78.Natural language processing pipelines to annotate BioC collections with an application to the NCBI disease corpus

机译：自然语言处理管道可用于注释BioC集合并应用于NCBI疾病语料库
- 作者：Donald C. Comeau;Haibin Liu;Rezarta Islamaj Doğan;W. John Wilbur
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
79.Curation accuracy of model organism databases

机译：模型生物数据库的定位精度
- 作者：Ingrid M. Keseler;Marek Skrzypek;Deepika Weerasinghe;Albert Y. Chen;Carol Fulcher;Gene-Wei Li;Kimberly C. Lemmer;Katherine M. Mladinich;Edmond D. Chow;Gavin Sherlock;Peter D. Karp
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
80.ParaPep: a web resource for experimentally validated antiparasitic peptide sequences and their structures

机译：ParaPep：用于实验验证的抗寄生虫肽序列及其结构的网络资源
- 作者：Divya Mehta;Priya Anand;Vineet Kumar;Anshika Joshi;Deepika Mathur;Sandeep Singh;Abhishek Tuknait;Kumardeep Chaudhary;Shailendra K. Gautam;Ankur Gautam;Grish C. Varshney;Gajendra P.S. Raghava
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
81.MorusDB: a resource for mulberry genomics and genome biology

机译：MorusDB：桑树基因组学和基因组生物学的资源
- 作者：Tian Li;Xiwu Qi;Qiwei Zeng;Zhonghuai Xiang;Ningjia He
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
82.IFIM: a database of integrated fitness information for microbial genes

机译：IFIM：一个综合的微生物基因适应性信息数据库
- 作者：Wen Wei;Yuan-Nong Ye;Sen Luo;Yan-Yan Deng;Dan Lin;Feng-Biao Guo
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
83.Egas: a collaborative and interactive document curation platform

机译：Egas：协作和交互式文档策划平台
- 作者：David Campos;Jóni Lourenço;Sérgio Matos;José Luís Oliveira
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
84.Web services-based text-mining demonstrates broad impacts for interoperability and process simplification

机译：基于Web服务的文本挖掘展示了对互操作性和流程简化的广泛影响
- 作者：Thomas C. Wiegers;Allan Peter Davis;Carolyn J. Mattingly
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
85.Finding abbreviations in biomedical literature: three BioC-compatible modules and four BioC-formatted corpora

机译：在生物医学文献中查找缩写：三个BioC兼容模块和四个BioC格式的语料库
- 作者：Rezarta Islamaj Doğan;Donald C. Comeau;Lana Yeganova;W. John Wilbur
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
86.miRror-Suite: decoding coordinated regulation by microRNAs

机译：miRror-Suite：解码microRNA的协调调控
- 作者：Yitzhak Friedman;Solange Karsenty;Michal Linial
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
87.Assisted curation of regulatory interactions and growth conditions of OxyR in E. coli K-12

机译：辅助管理大肠杆菌K-12中OxyR的调控相互作用和生长条件
- 作者：Socorro Gama-Castro;Fabio Rinaldi;Alejandra López-Fuentes;Yalbi Itzel Balderas-Martínez;Simon Clematide;Tilia Renate Ellendorff;Alberto Santos-Zavaleta;Hernani Marques-Madeira;Julio Collado-Vides
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
88.Automated semantic annotation of rare disease cases: a case study

机译：罕见疾病病例的自动语义注释：一个案例研究
- 作者：Maria Taboada;Hadriana Rodríguez;Diego Martínez;María Pardo;María Jesús Sobrido
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
89.aglgenes a curated and searchable database of archaeal N-glycosylation pathway components

机译：aglgenes古细菌N-糖基化途径成分的精选数据库
- 作者：Noa Godin;Jerry Eichler
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
90.Structuring osteosarcoma knowledge: an osteosarcoma-gene association database based on literature mining and manual annotation

机译：构建骨肉瘤知识：基于文献挖掘和人工注释的骨肉瘤基因关联数据库
- 作者：Kathrin Poos;Jan Smida;Michaela Nathrath;Doris Maugg;Daniel Baumhoer;Anna Neumann;Eberhard Korsching
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
91.HeteroGenome: database of genome periodicity

机译：HeteroGenome：基因组周期性数据库
- 作者：Maria Chaley;Vladimir Kutyrkin;Gayane Tulbasheva;Elena Teplukhina;Nafisa Nazipova
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
92.PTM-SD: a database of structurally resolved and annotated posttranslational modifications in proteins

机译：PTM-SD：蛋白质中结构解析和带注释的翻译后修饰的数据库
- 作者：Pierrick Craveur;Joseph Rebehmed;Alexandre G. de Brevern
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
93.BioCreative-IV virtual issue

机译：BioCreative-IV虚拟问题
- 作者：Cecilia N. Arighi;Cathy H. Wu;Kevin B. Cohen;Lynette Hirschman;Martin Krallinger;Alfonso Valencia;Zhiyong Lu;John W. Wilbur;Thomas C. Wiegers
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
94.iSimp in BioC standard format: enhancing the interoperability of a sentence simplification system

机译：iSimp采用BioC标准格式：增强句子简化系统的互操作性
- 作者：Yifan Peng;Catalina O. Tudor;Manabu Torii;Cathy H. Wu;K. Vijay-Shanker
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
95.dbCRY: a Web-based comparative and evolutionary genomics platform for blue-light receptors

机译：dbCRY：用于蓝光受体的基于Web的比较和进化基因组学平台
- 作者：Yong-Min Kim;Jaeyoung Choi;Hye-Young Lee;Gir-Won Lee;Yong-Hwan Lee;Doil Choi
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
96.TuberQ: a Mycobacterium tuberculosis protein druggability database

机译：TuberQ：结核分枝杆菌蛋白质可药性数据库
- 作者：Leandro Radusky;Lucas A. Defelipe;Esteban Lanzarotti;Javier Luque;Xavier Barril;Marcelo A. Marti;Adrián G. Turjanski
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
97.PhylOPDb: a 16S rRNA oligonucleotide probe database for prokaryotic identification

机译：PhylOPDb：用于原核生物鉴定的16S rRNA寡核苷酸探针数据库
- 作者：Faouzi Jaziri;Nicolas Parisot;Anis Abid;Jérémie Denonfoux;Céline Ribière;Cyrielle Gasc;Delphine Boucher;Jean-François Brugère;Antoine Mahul;David R.C. Hill;Eric Peyretaillade;Pierre Peyret
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
98.RegPhos 2.0: an updated resource to explore protein kinase–substrate phosphorylation networks in mammals

机译：RegPhos 2.0：探索哺乳动物蛋白激酶-底物磷酸化网络的更新资源
- 作者：Kai-Yao Huang;Hsin-Yi Wu;Yi-Ju Chen;Cheng-Tsung Lu;Min-Gang Su;Yun-Chung Hsieh;Chih-Ming Tsai;Kuo-I Lin;Hsien-Da Huang;Tzong-Yi Lee;Yu-Ju Chen
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
99.PLIC: protein–ligand interaction clusters

机译：PLIC：蛋白质-配体相互作用簇
- 作者：Praveen Anand;Deepesh Nagarajan;Sumanta Mukherjee;Nagasuma Chandra
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期
100.‘In silico expression analysis’ a novel PathoPlant web tool to identify abiotic and biotic stress conditions associated with specific cis-regulatory sequences

机译：计算机表达分析一种新颖的PathoPlant网络工具可识别与特定顺式调控序列相关的非生物和生物胁迫条件
- 作者：Julio C. Bolívar;Fabian Machens;Yuri Brill;Artyom Romanov;Lorenz Bülow;Reinhard Hehl
- 期刊名称：《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》 | 2014年第-1期