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Tracker: continuous HMMER and BLAST searching

机译:跟踪器:连续HMMER和BLAST搜索

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摘要

Tracker is a web-based email alert system for monitoring protein database searches using HMMER and Blast-P, nucleotide searches using Blast-N and literature searches of the PubMed database. Users submit searches via a web-based interface. Searches are saved and run against updated databases to alert users about new information. If there are new results from the saved searches, users will be notified by email and will then be able to access results and link to additional information on the NCBI website. Tracker supports Boolean AND/OR operations on HMMER and BLASTP result sets to allow users to broaden or narrow protein searches.
机译:Tracker是一个基于Web的电子邮件警报系统,用于监视使用HMMER和Blast-P进行的蛋白质数据库搜索,使用Blast-N进行的核苷酸搜索以及PubMed数据库的文献搜索。用户通过基于Web的界面提交搜索。搜索将被保存并针对更新的数据库运行,以向用户发出有关新信息的警报。如果保存的搜索结果有新结果,则将通过电子邮件通知用户,然后可以访问结果并链接到NCBI网站上的其他信息。 Tracker支持对HMMER和BLASTP结果集进行布尔AND / OR操作,以允许用户扩大或缩小蛋白质搜索范围。

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