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PFP/ESG: automated protein function prediction servers enhanced with Gene Ontology visualization tool

机译:PFP / ESG:借助Gene Ontology可视化工具增强的自动化蛋白质功能预测服务器

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摘要

Protein function prediction (PFP) is an automated function prediction method that predicts Gene Ontology (GO) annotations for a protein sequence using distantly related sequences and contextual associations of GO terms. Extended similarity group (ESG) is another GO prediction algorithm that makes predictions based on iterative sequence database searches. Here, we provide interactive web servers for the PFP and ESG algorithms that are equipped with an effective visualization of the GO predictions in a hierarchical topology.
机译:蛋白质功能预测(PFP)是一种自动功能预测方法,它使用远距离相关的序列和GO词的上下文关联来预测蛋白质序列的基因本体(GO)注释。扩展相似性组(ESG)是另一种GO预测算法,该算法基于迭代序列数据库搜索进行预测。在这里,我们为PFP和ESG算法提供了交互式Web服务器,这些服务器配备了分层拓扑结构中GO预测的有效可视化。

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